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独立跨学科学术机构是现今美国研究型大学学术组织变革中出现的新形式，其项目导向性、学科交叉性和组织开放性的特征促进了学科的交叉融合，并有利于实现突破性的知识创新。本文选取了3所美国顶尖研究型大学：哈佛大学、斯坦福大学和麻省理工学院，对其独立跨学科学术机构的建设概况、突出功能和保障因素予以解析，既而对我国高校独立跨学科学术机构的建设提出了参考性意见。