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在养禽业，微生物监测已成为一项日常工作。但在养猪业中，这一方法至今仍很少使用。首先，据认为猪舍的清洗和消毒的效果不如鸡舍（每批鸡结束饲养后，鸡舍将被完全清空）。这也是猪农犹豫不决是否要使用这一方法的原因。由DGZ完成的临床试验也证明了对猪舍中的微生物进行监测是检测所使用的清洗和消毒规程是否到位或对规程的调整进行评估的一种有效方法。