保护农民权益是集体经营性建设用地入市的核心问题，农户对入市收益分配的满意度是反映集体经营性建设用地入市实施情况的重要因素。基于重庆市大足区的实践，分析其集体经营性建设用地入市现状、取得的成效以及存在的问题，并运用二元Logistic模型探究重庆市大足区农户对集体经营性建设用地入市收益分配的满意度。结果表明：（1）研究区内50.98%的农户对集体经营性建设用地入市的收益分配感到满意，49.02%的农户表示不满意，表明对集体经营性建设用地入市后的收益分配满意的农户占比不高；（2）年龄与农户对集体经营性建设用地入市收益分配的满意度呈负相关，家庭经济能力、入市政策的了解程度、所认为的最大收益获得者、收益分配公开程度、村集体资金管理规范程度，以及集体经营性建设用地入市后农户生活水平变化都对收益分配的满意度有显著正向作用。因此，应当多措并举，稳步提高农民收入；通过加强农民对相关政策的了解；推进信息公开，规范资金的管理与使用；采取合理的分配标准；健全收益分配争议的解决机制来提升农户满意度，保障农民权益。