土壤重要动物白符虫兆(Folsomia candida)基因组的重新组装与注释

来源 :南京农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sheishei
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[目的]本文利用公开可用的PacBio测序数据进行白符虫兆(Folsomia candida)基因组的重新组装和注释,以提升该物种基因组组装的连续性和注释基因的完整性。[方法]使用Flye和Falcon进行组装,使用quickmerge合并组装结果。基因注释由MAKER完成,整合了从头(de novo)预测、转录本和蛋白质同源证据。其中转录组基于StringTie组装结果。[结果]新组装的基因组大小为221.09 Mb,共113条序列(scaffolds),其中最长scaffold为30.07 Mb,N5
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