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【目的】调查黑龙江省大豆灰斑病菌（Cercospora sojina）的生理小种类型，分析黑龙江省大豆灰斑病菌各生理小种间的亲缘关系。【方法】2006—2011年，对黑龙江省进行大豆灰斑病样本的采集和病菌的分离。利用11对SSR引物对黑龙江省的24个灰斑病菌菌株进行EST-SSR基因型分析。【结果】共分离获得大豆灰斑病菌2 674株，鉴定出1—15号共15个生理小种。SSR结果共检测出等位变异46个，平均每个位点为4.2个，相似系数范围为0.091—0.956，平均相似性系数达到0.589。聚类分析结果与