产甲烷常温菌和嗜热菌代谢网络特征的比较研究

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以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络为研究对象,分析了网络的拓扑结构与功能之间的关联性。本文利用Networkx计算了代谢网络的度、度的中心性、紧密度中心性以及介数中心性等参数值,通过比较分析发现常温古细菌MAC和嗜热古细菌MKA存在氨基酸代谢以及碳水化合物代谢保守途径,且都具有明显更高的度。结果同时表明子途径00010(糖酵解/糖异生)、00020(柠檬酸循环)、00250(丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢)是常温古细菌MAC与嗜热古细菌MKA2个生物体的重要途径。
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