【摘 要】
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根据NCBI已公布的花斑无须鲶全基因组序列,利用MISA软件对花斑无须鲶全基因组的6种完整型微卫星进行筛选并分析其分布特征.结果如下:在花斑无须鲶全基因组(约1.03Gb)中符合条件的微卫星序列共336037个,丰度为326个/Mb.微卫星总长度为7720686 bp,占花斑无须鲶全基因组的0.75%.其中二碱基类型的微卫星数目最多,为145318个,占微卫星总数的43.24%,其次分别为单碱基(37.12%)、三碱基(11.00%)、四碱基(7.39%)、五碱基(1.04%)和六碱基(0.21%).花斑
【机 构】
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南京师范大学海洋科学与工程学院,江苏省特色水产育种与绿色高效养殖技术工程研究中心
【基金项目】
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江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201742),江苏省重点研发计划(现代农业)重点项目(BE2017377),江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(19)2034),南京师范大学大学生创新创业训练计划项目。
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根据NCBI已公布的花斑无须鲶全基因组序列,利用MISA软件对花斑无须鲶全基因组的6种完整型微卫星进行筛选并分析其分布特征.结果如下:在花斑无须鲶全基因组(约1.03Gb)中符合条件的微卫星序列共336037个,丰度为326个/Mb.微卫星总长度为7720686 bp,占花斑无须鲶全基因组的0.75%.其中二碱基类型的微卫星数目最多,为145318个,占微卫星总数的43.24%,其次分别为单碱基(37.12%)、三碱基(11.00%)、四碱基(7.39%)、五碱基(1.04%)和六碱基(0.21%).花斑
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