综述了果树种质资源与遗传育种研究进展及若干问题的理解与思考，主要结果如下：1.中国虽然是柑橘、苹果、梨、桃、龙眼、枇杷、香蕉、猕猴桃、李、杏、枣和柿等多种果树的起源演化中心（之一），是世界上最大的果树资源国，但野生种质和名特优地方品种的发掘、创新与利用有待进一步加强。2.按照遗传变异的来源，果树常规育种主要有杂交育种和芽变选种两个途径；果树杂种一代广泛分离，每一次育种都选择杂种优势最强的基因型，通过无性繁殖成为新的营养系品种，并在生产上长期利用，而显性、超显性和上位性3大假说是杂种优势形成的主要遗传基础；对‘富士’和‘鲁丽’苹果、‘玫瑰香’葡萄及‘山农酥’梨等新品种及其亲本主要性状分析发现，选择具有互补性状的品种作为杂交亲本，并选择遗传背景复杂的品种作为杂交母本，是果树杂种优势高效利用及其亲本选择选配的重要结论；杂交育种是根据产业的品种需求确定育种目标，进行亲本选择与选配，培育双亲性状互补、杂种优势明显的新品种，而芽变选种是利用体细胞自然突变及其表观遗传对生产上的主栽品种个别性状进行修缮和改良；因此，杂交育种和芽变选种有机结合是解决果树产业品种问题的重要技术途径。3.面对国家乡村振兴的战略需求及关于“坚持凭能力、实绩、贡献评价人才，克服唯学历、唯资历、唯论文等倾向”的人才评价机制改革，深度解读了农业科技人员必须坚持“理论与技术创新并重及良种良法配套”的科研思路及其经典案例。