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目前种子纯度检验技术已由外观形态发展到生理生化水平和分子水平上的鉴定。种子纯度检验方法目前有形态学方法、蛋白质电泳技术检验法、DNA分子标记技术检验法。所谓形态学方法是检验人员借助放大镜、解剖镜等工具，依据某一作物品种不同于其他品种的特定外观形态特征来进行鉴定的方法。蛋白质电泳技术检验法是指利用电泳技术对备检样品的种子或幼苗的蛋白质进行分离、染色，形成蛋白质电泳谱带的差异，并与标准品种相比较，从而鉴定品种的真实性和纯度的一种方法。DNA分子标记技术检验法是利用品种间形态和生化上的区别，归根到底是品种间在基因（DNA）上的区别。DNA分子标记技术是通过对品种DNA的多态性，即DNA碱基序列的差异进行分析，从而鉴别不同品种。其监测对象是种子的DNA片段（基因），没有器官的特异性，不受环境的影响，有较高的准确性、稳定性和重复性。现将形态学检验法介绍如下。
一、种子形态检验法
1.看粒形
种子粒形一般有马齿形、圆形、椭圆形、扁形、长形、长方形等不同类型，但不论其属于哪种类型，都必须大小一致、整齐、角棱一样，颗粒的凹凸面相等，并无病粒、异形粒和破粒等。
2.看粒色
农作物种子有黄色、浅黄色、深黄色、红色、红黄色、绿色、黑色、白色等。其中玉米还有白轴、红轴之分。但不论什么品种，属于一个品种的粒色都必须一致，不能有差别。
3.看光泽
新鲜的种子一般光泽鲜艳发亮并一致。不能有霉、污和烂粒；一般暗淡无光泽的种子，不是旧种、陈种，就是过了水或雨淋过的种子。
4.看结构
一般作物种子，都由胚胎、胚乳、种皮三部分组成。鉴别时可用牙齿咬开，或用刀切开，尔后再看它内部的结构、硬度、软度、松度和颜色是否一致。
5.看种皮
种皮的颜色、薄厚必须一致，如鉴别小麦、玉米、豆子等作物种子，要事先用水浸泡24h（冬季和夏季一样），尔后用手将种子拨开，即可观察出它的种皮薄厚是否一致。根据种子形状、大小、色泽、质地、表面的光和毛以及种子外表各部位的特征来加以鉴别，以区分本品种与其他品种。该法简单、经济、快速，但准确性较差，且随着现代育种科学的发展，不同品种间种子外观形态的差异越来越小。因此，靠区别种子形态上的差异来鉴定种子纯度也变得越来越困难。
二、种苗形态检验法
该法根据不同品种幼苗的独特形状进行检验，如幼苗芽鞘颜色、幼苗生长锥、子叶的形状、颜色、大小等。该法简便、省时，但受环境的影响颇大，检验结果不够可靠。田间减压纯度，其目的是核查种子田的品种特征、特性是否名副其实，以及影响收获种子质量的各种信息情况，从而采取相应的措施确保种子收获时符合规定的质量要求。种田生产时，在整个生长季节可以检查多次，通常为苗期、花期、成熟期，一般在某种特征性表现最充分、最明显的时期检查1次。
1.水稻
一般检查3次：第1次在苗期至始穗期前检查隔离条件和砸株；第2次在花期；第3次为成熟期。
1.1主要性状。营养期检查第2叶的叶耳颜色；开花期检查抽穗时间（50%抽穗）、小穗柱头颜色、除花序外的茎长度。
1.2次要性状。营养期检查叶颜色、叶颜色的分布、第二片叶的叶片茸毛、旗叶的叶片弯曲；开花期检查外稃龙骨瓣颜色、外稃顶的颜色、茎厚度、茎上节颜色、花序长度、花序主轴的弯曲、小穗外稃上的茸毛、穗外稃茸毛、小穗外稃顶部的颜色、花序最长芒的长度、花序芒的分布；成熟期检查成熟时间、谷粒千粒重、谷粒长度、谷粒宽度、变色谷粒长度、变色谷粒宽度、变色谷粒形状、变色谷粒颜色、精米心白大小、胚乳类型。
2.小麦和大麦
一般检查2次：第1次在开花前检查隔离条件和杂株；第2次在开花期检查杂株。
2.1小麦。主要性状：抽穗期检查旗叶姿态、抽穗时间（50%穗出现小穗时）、旗叶鞘变绿、旗叶背变绿、穗变绿、秆茎变绿、植株高度（茎和穗）、穗形状、长芒或短芒有无、穗顶部的短芒的长度；成熟期检查穗颜色。次要性状：分蘖前检查旗叶的叶耳颜色、杆上位节的茸毛、麦秆的节截面（穗和茎节）、花药颜色、穗顶长芒的长度、穗轴节片的突面或茸毛、护颖的肩宽、护颖的肩形、护颖的喙长、护颖的喙形、护颖的内部茸毛延伸、护颖的内侧纹迹、冬春性；成熟期检查粒形、粒色、籽粒刷毛长、子粒的苯酚反应。
2.2大麦。主要性状：抽穗期检查旗叶姿态、旗叶的叶耳颜色、旗叶的叶耳色素密度、旗叶的叶鞘变绿、穗出现时间（50%穗出现第1小穗）、芒的顶部颜色、芒顶颜色分布、穗变绿、穗姿态、植株高度、穗梭数、穗密度、芒与穗的长度比。次要性状：分蘖期检查植株生长习性、低叶位的叶鞘茸毛；抽穗期检查穗性状、芒边缘的刺、小穗轴的第1穗轴节长度、小穗轴的第一穗轴弯曲、小穗轴的第一穗轴尖峰、小穗轴的第一穗轴形状、不育小穗的姿态、不育小穗外稃长度、不育小穗的顶部性状、中位小穗与子粒有关的颖和芒长度、籽粒的小穗轴茸毛长度、子粒外壳、子粒外稃构造颜色、子粒内稃侧背脉纹、子粒腹沟的茸毛、籽粒鳞被性状、果穗淀粉层颜色、冬春性。
检验员应该独立地根据检验结果报告田间状况并做出评价。如果检验时某些植株难以从特征特性加以确认，在得出结论之前需要进行第2次或更多次检验。
一、种子形态检验法
1.看粒形
种子粒形一般有马齿形、圆形、椭圆形、扁形、长形、长方形等不同类型，但不论其属于哪种类型，都必须大小一致、整齐、角棱一样，颗粒的凹凸面相等，并无病粒、异形粒和破粒等。
2.看粒色
农作物种子有黄色、浅黄色、深黄色、红色、红黄色、绿色、黑色、白色等。其中玉米还有白轴、红轴之分。但不论什么品种，属于一个品种的粒色都必须一致，不能有差别。
3.看光泽
新鲜的种子一般光泽鲜艳发亮并一致。不能有霉、污和烂粒；一般暗淡无光泽的种子，不是旧种、陈种，就是过了水或雨淋过的种子。
4.看结构
一般作物种子，都由胚胎、胚乳、种皮三部分组成。鉴别时可用牙齿咬开，或用刀切开，尔后再看它内部的结构、硬度、软度、松度和颜色是否一致。
5.看种皮
种皮的颜色、薄厚必须一致，如鉴别小麦、玉米、豆子等作物种子，要事先用水浸泡24h（冬季和夏季一样），尔后用手将种子拨开，即可观察出它的种皮薄厚是否一致。根据种子形状、大小、色泽、质地、表面的光和毛以及种子外表各部位的特征来加以鉴别，以区分本品种与其他品种。该法简单、经济、快速，但准确性较差，且随着现代育种科学的发展，不同品种间种子外观形态的差异越来越小。因此，靠区别种子形态上的差异来鉴定种子纯度也变得越来越困难。
二、种苗形态检验法
该法根据不同品种幼苗的独特形状进行检验，如幼苗芽鞘颜色、幼苗生长锥、子叶的形状、颜色、大小等。该法简便、省时，但受环境的影响颇大，检验结果不够可靠。田间减压纯度，其目的是核查种子田的品种特征、特性是否名副其实，以及影响收获种子质量的各种信息情况，从而采取相应的措施确保种子收获时符合规定的质量要求。种田生产时，在整个生长季节可以检查多次，通常为苗期、花期、成熟期，一般在某种特征性表现最充分、最明显的时期检查1次。
1.水稻
一般检查3次：第1次在苗期至始穗期前检查隔离条件和砸株；第2次在花期；第3次为成熟期。
1.1主要性状。营养期检查第2叶的叶耳颜色；开花期检查抽穗时间（50%抽穗）、小穗柱头颜色、除花序外的茎长度。
1.2次要性状。营养期检查叶颜色、叶颜色的分布、第二片叶的叶片茸毛、旗叶的叶片弯曲；开花期检查外稃龙骨瓣颜色、外稃顶的颜色、茎厚度、茎上节颜色、花序长度、花序主轴的弯曲、小穗外稃上的茸毛、穗外稃茸毛、小穗外稃顶部的颜色、花序最长芒的长度、花序芒的分布；成熟期检查成熟时间、谷粒千粒重、谷粒长度、谷粒宽度、变色谷粒长度、变色谷粒宽度、变色谷粒形状、变色谷粒颜色、精米心白大小、胚乳类型。
2.小麦和大麦
一般检查2次：第1次在开花前检查隔离条件和杂株；第2次在开花期检查杂株。
2.1小麦。主要性状：抽穗期检查旗叶姿态、抽穗时间（50%穗出现小穗时）、旗叶鞘变绿、旗叶背变绿、穗变绿、秆茎变绿、植株高度（茎和穗）、穗形状、长芒或短芒有无、穗顶部的短芒的长度；成熟期检查穗颜色。次要性状：分蘖前检查旗叶的叶耳颜色、杆上位节的茸毛、麦秆的节截面（穗和茎节）、花药颜色、穗顶长芒的长度、穗轴节片的突面或茸毛、护颖的肩宽、护颖的肩形、护颖的喙长、护颖的喙形、护颖的内部茸毛延伸、护颖的内侧纹迹、冬春性；成熟期检查粒形、粒色、籽粒刷毛长、子粒的苯酚反应。
2.2大麦。主要性状：抽穗期检查旗叶姿态、旗叶的叶耳颜色、旗叶的叶耳色素密度、旗叶的叶鞘变绿、穗出现时间（50%穗出现第1小穗）、芒的顶部颜色、芒顶颜色分布、穗变绿、穗姿态、植株高度、穗梭数、穗密度、芒与穗的长度比。次要性状：分蘖期检查植株生长习性、低叶位的叶鞘茸毛；抽穗期检查穗性状、芒边缘的刺、小穗轴的第1穗轴节长度、小穗轴的第一穗轴弯曲、小穗轴的第一穗轴尖峰、小穗轴的第一穗轴形状、不育小穗的姿态、不育小穗外稃长度、不育小穗的顶部性状、中位小穗与子粒有关的颖和芒长度、籽粒的小穗轴茸毛长度、子粒外壳、子粒外稃构造颜色、子粒内稃侧背脉纹、子粒腹沟的茸毛、籽粒鳞被性状、果穗淀粉层颜色、冬春性。
检验员应该独立地根据检验结果报告田间状况并做出评价。如果检验时某些植株难以从特征特性加以确认，在得出结论之前需要进行第2次或更多次检验。