SSCP技术检测松毛虫赤眼蜂mtDNA编码区SNPs的可行性研究

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SNPs标记是最具广泛利用潜力的第3代遗传标记,本研究旨在了解SSCP技术检测松毛虫赤眼蜂Trichogramma dentrolimi mtDNA编码区SNPs的灵敏度和精确度,建立大规模筛查SNPs的技术平台。结果表明,运用SSCP技术检测40个松毛虫赤眼蜂样本,单倍型检出率达100%。Cytb和COⅡ基因SNPs的平均密度分别为19SNPs/kb和16 SNPs/kb。SSCP技术操作简单、成本低廉、结果直观、易于分型,适于松毛虫赤眼蜂线粒体编码区未知SNPs的检测,建立了基于SSCP技术检测松毛虫赤眼蜂mtDNA SNPs的技术平台。 The purpose of this study is to understand the sensitivity and accuracy of SSCP technique in detecting SNPs in Trichogramma dentrolimi mtDNA coding region and to establish a technology platform for large-scale screening of SNPs. The results showed that the detection rate of 40 haplogroups of Tricholoma pilosulae by SSCP was 100%. The average density of SNPs for Cytb and COII genes was 19 SNPs / kb and 16 SNPs / kb, respectively. SSCP technique is simple, low cost, intuitive and easy to type. It is suitable for the detection of unknown SNPs in the mitochondrial coding region of Trichogramma dendrolimi and establishes the technology platform for detecting mtDNA SNPs of T. trichomus based on SSCP technique.
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