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方法变异是由研究方法导致的系统误差。方法变异既可能产生结构层面的影响,也可能产生题目层面的影响;既可能影响单个结构的测量,也可能影响用相同方法研究的多个结构之间的关系,还可能影响用相同方法研究的多个研究之间的关系,进而影响到相关领域的理论建构。在控制方法变异时,可采取过程控制法和统计控制法,最好先用过程控制法。