基于表达序列标签的萝卜ACA36基因簇鉴定

来源 :四川大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：dd398622409xiewenjin

【摘要】

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利用国际公用的表达序列标签（EST）数据库资源，运用生物信息学分析方法，在萝卜（Raphanus sativus）一条表达序列标签中发现一个新的snoRNA基因簇．此基因簇含有一个box H／ACA snoRNA基因

【作者】

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徐玲程加富胡娜殷秋平

【机构】

：

江西科技师范学院生命科学学院

【出处】

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四川大学学报(自然科学版)

【发表日期】

：

2009年5期

【关键词】

：

核仁小分子RNA 表达序列标签生物信息学 ACA36基因簇 snoRNA EST bioinformatics ACA36 cluster

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利用国际公用的表达序列标签（EST）数据库资源，运用生物信息学分析方法，在萝卜（Raphanus sativus）一条表达序列标签中发现一个新的snoRNA基因簇．此基因簇含有一个box H／ACA snoRNA基因和两个box C／DsnoRNA基因，分别命名为RsACA36、RssnoR66和RsSNORD88．ACA36可形成典型的box H／ACA snoRNA双茎环二级结构；snoR66和SNORD88都具有典型的C盒与D盒保守元件，末端存在反向互补序列；三个snoRNA都含有能和核糖体RNA互

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