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目的 建立适应公立医院改革背景的医院内部绩效工资分配测算方法。方法 监控样本医院内部绩效工资分配的运行情况，梳理绩效工资分配测算方法的短板。进行文献研究、医务人员访谈，分析医务人员反馈意见。对绩效工资分配模拟测算结果进行对比分析。结果 建立了包含基础奖、完成率奖、超额奖的三阶段测算方法，依据科室在各阶段的贡献程度测算绩效工资。三阶段测算方法能有效实现医院控制内部绩效工资分配的效率与公平的平衡，方法运行稳健。结论 三阶段测算方法促进医院改进内部绩效工资分配工作的质量和效率。