【摘 要】
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目的 采用生物信息学方法分析外源性绵羊肺腺瘤病毒新疆株env囊膜蛋白的结构和功能.方法 利用NCBI数据库查询外源性对绵羊肺腺瘤病毒新疆株env囊膜蛋白基因序列,采用在线软件ProtParam、Prot Scale、DNAS-TAR、SOPMA、SWISS MODEL、 SOSUI、TMHMM2.0、Signal 4.1、Bepipred Linear Epitope Prediction、PROSITE SCAN、PSOTR分析预测env蛋白的理化性质、亲疏水性、二级结构、三级结构、跨膜区、信号肽、B细
【机 构】
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黔西南民族职业技术学院,贵州兴义562400;贵州慧创科技发展有限公司;黔西南民族职业技术学院,贵州兴义562400;石河子大学动物科技学院人兽共患病实验室
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目的 采用生物信息学方法分析外源性绵羊肺腺瘤病毒新疆株env囊膜蛋白的结构和功能.方法 利用NCBI数据库查询外源性对绵羊肺腺瘤病毒新疆株env囊膜蛋白基因序列,采用在线软件ProtParam、Prot Scale、DNAS-TAR、SOPMA、SWISS MODEL、 SOSUI、TMHMM2.0、Signal 4.1、Bepipred Linear Epitope Prediction、PROSITE SCAN、PSOTR分析预测env蛋白的理化性质、亲疏水性、二级结构、三级结构、跨膜区、信号肽、B细胞表位、结构域、亚细胞定位.结果 env蛋白由615个氨基酸组成,分子式为C3144 H4924 N840 O870S29,相对分子质量为69.5×103,理论等电点为8.48,不稳定系数为37.04(为稳定蛋白),脂肪系数平均为99.56,总平均亲水性为-0.048.二级结构以α-螺旋为主,占42.769,无规卷曲占38.7％,延伸链占16.59％,β-转角占1.59％.三级结构env蛋白序列与同源模板的序列在408～540区域存在21％的同源性,只能进行部分同源建模.env蛋白存在2个跨膜区,无信号肽.env蛋白包含有20个线性表位,其中356-442、490-555、104-131、206-230、448-469区段是env蛋白的优势抗原表位区段.env蛋白包含9个N-糖基化位点,4个蛋白激酶C磷酸化作用位点,4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化作用位点,4个N-豆蔻酰基化位点,1个酰胺化位点,1个细胞附着序列位点.亚细胞定位分析预测env蛋白为细胞膜蛋白,env蛋白绵羊肺腺瘤病毒的囊膜蛋白.结论 外源性绵羊肺腺瘤病毒新疆株env囊膜蛋白存在多个B细胞抗原表位及1个细胞附着序列位点,可作为潜在抗原用于env蛋白绵羊肺腺瘤病毒感染疫苗的研制.
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目的 探讨肺部细菌感染评分(CPIS)对大面积脑梗死(LHI)并发吸入性肺炎患者预后的评估价值.方法 2018年1月-2020年12月本院收治的LHI合并吸入性肺炎患者116例,均根据自身情况选择合适营养方式,住院31～97 d,依据住院后生存状况分为死亡组和生存组.收集患者的性别、年龄、既往病史、饮酒、吸烟、入院收缩压及美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分,入院24 h血常规、肾功能指标、血糖、血脂等资料,根据简化的CPIS标准对其中的体温、气管分泌物、氧和指数、胸部X线片等进行评分,采用Log
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