【摘 要】
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为了找出差异基因用于高油酸油菜育种,对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4％和56.2％)成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析.Illumina HiseqTM200
【机 构】
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湖南农业大学农学院,南方粮油作物协同创新中心,长沙,410128;农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,武汉,430062
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为了找出差异基因用于高油酸油菜育种,对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4％和56.2％)成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析.Illumina HiseqTM2000测序得到8.09 Gbclean reads,组成52 361个unigene,平均长度为659 bp.比对公共数据库得到48 911 (93.41％)个氨基酸序列.鉴定出6 414个在高油酸油菜和低油酸油菜中差异显著的基因,这些基因有1 296个在高油酸油菜中上调表达(20.21％),5 118个下调表达(79.79％),共有2 043个差异基因在119个代谢通路中富集表达.将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证.Bna0799930,Bna0104450和Bna0305890在高油酸油菜中上调表达,其余的下调表达.Bna0501620,Bna0391450和Bna0084310在高油酸油菜中的表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上,分别为4.48倍,4.21倍和2.26倍.这些新发现的差异基因可用于高油酸油菜分子育种研究.
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