【摘 要】
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为使高性能计算助力群体遗传学和系统地理学研究,提出一种基于MPI(message passing interface)的群体遗传学分析软件,利用集群中多个CPU核心的计算能力加速群体遗传学分析。
【机 构】
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山西省气象信息中心,北京计算机技术及应用研究所,国网河北省电力公司,中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心
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为使高性能计算助力群体遗传学和系统地理学研究,提出一种基于MPI(message passing interface)的群体遗传学分析软件,利用集群中多个CPU核心的计算能力加速群体遗传学分析。进行正确性验证,对并行加速比和并行效率进行评估,在保证计算结果正确性前提下,利用256个CPU核心时可以得到最好的并行加速比(185.16),在利用128个CPU核心时可以得到最好的并行效率(93.68%)。实验结果表明,利用高性能计算能够进行快速有效的群体遗传学分析。
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