小鼠胚胎胃肠道和胎盘组织的菌群构成研究

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目的

探讨小鼠胚胎胃肠道和胎盘组织的菌群构成。

方法

采集昆明系孕鼠的胚胎组织和胎盘组织24份,分别为孕早期(孕12~13 d)胚胎胃肠道组织、孕晚期(孕19~20 d)胚胎胃肠道组织和孕晚期(孕19~20 d)胎盘组织各8份。应用血液或组织DNA提取试剂盒提取胃肠道组织和胎盘组织菌群的DNA,然后将24个样本所提取的DNA进行高通量测序。统计学方法采用方差分析。

结果

孕鼠胚胎胃肠道组织及胎盘组织的菌群在"门"水平有4个优势菌群,分别是变形菌门(95.00%、88.14%、87.26%),拟杆菌门(1.71%、2.15%、2.63%),放线菌门(1.16%、4.10%、3.38%)及厚壁菌门(0.75%、2.62%、2.01%)。在科水平有9个优势菌科,其中以肠杆菌科(46.99%、44.34%、41.08%)、希瓦菌科(21.99%、21.10%、19.05%)、莫拉菌科(9.18%、7.09%、5.64%)为主。菌群种类孕早期和孕晚期胚胎胃肠道菌群分别为65.44%和62.73%,与孕晚期胎盘组织菌群相同。菌群丰度"科"水平3组相同菌群的含量分别占78.16%、72.53%及65.78%。

结论

胚胎胃肠道和胎盘组织有菌群定植,同时对其进行了分类。

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