【摘 要】
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豚鹿Axis porcinus是国家一级重点保护野生动物，为理解其基因表达上的基本特征，本研究采用RNA-seq技术对16个豚鹿血液样本进行了测序和从头组装，一共得到615 548条unigenes,Contig N50为803 bp。将组装的转录本进行同源序列比对注释，发现豚鹿血液在信号转导、抗病毒感染和免疫系统等通路上表达的基因最丰富。通过比较雌雄豚鹿的差异表达基因（DEGs），鉴定了1 78
【机 构】
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四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室
【基金项目】
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成都大熊猫繁育研究基金会项目（CPF2017-06）；
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豚鹿Axis porcinus是国家一级重点保护野生动物，为理解其基因表达上的基本特征，本研究采用RNA-seq技术对16个豚鹿血液样本进行了测序和从头组装，一共得到615 548条unigenes,Contig N50为803 bp。将组装的转录本进行同源序列比对注释，发现豚鹿血液在信号转导、抗病毒感染和免疫系统等通路上表达的基因最丰富。通过比较雌雄豚鹿的差异表达基因（DEGs），鉴定了1 781个在雄性中显著上调和14个显著下调的性别差异表达基因，雄性的高表达DEGs远多于雌性，且主要富集在精子形成、睾丸功能和自身免疫相关通路，暗示雌雄豚鹿在生殖发育和自身免疫方面存在较大差异。部分可能与鹿角生长相关的基因（Rela、ADAMTS2、OLIG1、Snai1、PTH1R、TGFBI、MMP9）均在雄性豚鹿中显著高表达。本研究为丰富豚鹿转录表达提供了基础数据，为进一步深入挖掘豚鹿功能基因、分子标记开发以及鹿角形成机制提供了参考。
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