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对影响棉花AFLP技术体系的多种因素作了探讨，提到了一种适于棉花AFLP银染技术的优化体系。该体系中各优化因素为：（1）模板DNA浓度为150ng·μL^-1；（2）酶切体系中，Msel和EcoRI各加入3umits，使用NEB buffer2，反应时间为2h；（3）连接最适反应时间为10h；（4）连接产物最适稀释倍数为10倍；（5）预扩增产物最适稀释倍数为10倍。