【摘 要】
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为深入挖掘火龙果SSR和SNP分子标记,以自交亲和型火龙果新种质‘黔蜜龙’转录组序列为基础,系统分析了SSR和SNP位点多态性和分布特征。转录组序列组装共获得96 800个unigene,
【基金项目】
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贵州省重点科技攻关项目(黔科合NZ[2015]3001号);公益性行业(农业)科研专项(No.201403036);贵州省改革转制项目(黔科合体Z字[2014]4003号);贵州省科技计划项目([黔科合平台人才(2017)5603]);贵州省自然科学基金(黔科合J字[2015]2083号)
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为深入挖掘火龙果SSR和SNP分子标记,以自交亲和型火龙果新种质‘黔蜜龙’转录组序列为基础,系统分析了SSR和SNP位点多态性和分布特征。转录组序列组装共获得96 800个unigene,其中28 471个unigene在数据库中得到注释,在各个数据库中均得到注释的有5 800个。从unigene中搜寻到26 167个SSR位点,出现频率为0.35个/kb。SSR重复类型共180种,单核苷酸重复最多（66.00%）,其次为二核苷酸重复（23.01%）、三核苷酸重复（9.99%）,其他类型较少（1.00%）
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