目前治疗乙肝的药物主要是核苷类抗病毒药物，如拉米夫定、恩替卡韦等。但许多患者对抗病毒治疗的复杂性、长期性认识不足。据调查，在接受抗病毒治疗的乙肝患者中，约63%曾自行中断治疗，约65%只能坚持1～3年治疗，致使病情反弹恶化，应当予以重视。
　　乙肝难以根治的两大原因
　　一是乙肝病毒只能抑制，不能清除：人感染乙肝病毒后，病毒DNA会在肝细胞核中形成一个环状的双股DNA，称为CCC-DNA。它是复制新病毒的源头，具有高度的稳定性，在肝细胞内长期存在和复制。目前医学界尚无任何药物能直接作用于干细胞核内的CCC-DNA，故无法完全清除乙肝病毒，只能对乙肝病毒起抑制作用。因而，一旦擅自停药，乙肝病毒就会以CCC-DNA为模板继续复制，造成肝病复发。
　　二是患者的个体因素———免疫耐受难打破：免疫是指机体识别和清除抗原物质（如病原体）的能力。我国的慢性乙肝患者大多起始于幼龄期，特别是母婴传播，免疫功能不成熟，免疫系统中许多有抗病毒作用的特异性淋巴细胞不完善，对乙肝病毒的免疫反应很差，医学上称之为“免疫耐受状态”。幼龄期感染乙肝病毒者多維持长时间的免疫耐受。免疫耐受就像一个坚固的壁垒，至今没有任何药物可以打破这个壁壘。
　　慢性乙肝的治疗对策
　　慢性乙肝的治疗是一个有相当难度的医疗工程，患者必须进行长期的抗病毒治疗，最大限度地将乙肝病毒长期抑制在最低水平，使肝脏炎症得以控制，肝纤维化的进程被遏制甚至逆转，减少或终止慢性肝炎进展到肝硬化甚至肝癌的风险。我们在临床上也发现，一些抗病毒治疗取得较好疗效的病人，在医生指导下长期坚持服用抗病毒药物，最终达到病毒被完全抑制，停药后也未再复发。
　　长期用药究竟要用到什么时候？我国2015年《慢性乙肝防治指南》指出：应用核苷类抗病毒药物，除达到乙肝病毒DNA测不到，ALT（谷丙转氨酶）恢复正常外，e抗原阳性者需达到血清转换（即e抗原转阴，e抗体转阳）后再巩固治疗3年仍保持不变，总疗程至少4年，可考虑停药；e抗原阴性者停药后复发率更高，因此所需疗程更长，要达到乙肝表面抗原消失，再巩固治疗1年保持不变，可考虑停药。对乙肝肝硬化者，以上停药标准是停药前提，《指南》鼓励延长疗程，以防复发。