【摘 要】
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目的 探讨核转运蛋白(Karyopherinα2,KPNA2)基因mRNA在人结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达、生物学功能、相关信号通路以及和患者预后的相关性.方法 癌症基因组图谱数据库(TCGA)分析KPNA2基因在CRC患者癌组织和正常肠上皮中的差异表达.STRING数据库构建KPNA2基因编码蛋白相互作用网络.Pearson相关分析与KPNA2基因共表达基因及其相关系数.Log-rank检验分析KPNA2基因高低表达组CRC患者总生存(OS)和无疾病进展生存(DFS)有
【机 构】
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天津市北辰医院,天津 300400
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目的 探讨核转运蛋白(Karyopherinα2,KPNA2)基因mRNA在人结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达、生物学功能、相关信号通路以及和患者预后的相关性.方法 癌症基因组图谱数据库(TCGA)分析KPNA2基因在CRC患者癌组织和正常肠上皮中的差异表达.STRING数据库构建KPNA2基因编码蛋白相互作用网络.Pearson相关分析与KPNA2基因共表达基因及其相关系数.Log-rank检验分析KPNA2基因高低表达组CRC患者总生存(OS)和无疾病进展生存(DFS)有无差异.结果 KPNA2基因在CRC患者肿瘤组织中的表达水平显著高于正常组织(P<0.05).KPNA2基因与其他蛋白相互作用指数为11.0,区域聚类指数为0.72,各个蛋白呈现明显的聚类表达(P<0.05).KPNA2基因编码产物主要定位于细胞核、蛋白复合体和细胞膜,其分子功能主要富集于蛋白结合、酶活性调节和核蛋白结合,而生物学过程主要为细胞生物学过程调节、代谢调节和细胞增殖.信号通路主富集于p53信号通路(肿瘤抑制信号通路)、细胞衰老信号通路以及细胞周期信号通路.Pearson相关性分析显示,PSMD12与KPNA2基因表达水平上存在正相关(r=0.74,P<0.05),而YPEL3与KPNA2基因表达存现负相关(r=-0.48,P<0.05).KPNA2基因低表达CRC患者总生存优于高表达患者(HR=0.51,P0.05).结肠癌患者KPNA2基因低表达组总生存优于高表达组(HR=0.42,P0.05).结论 KPNA2基因CRC患者肿瘤组织中呈现高表达,且高表达者总生存期较短.KPNA2基因有可能作为CRC患者预后的分子标志物.
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