基于多窗口不同特征的蛋白质相互作用位点预测

来源 :安徽大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liff09020625
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识别蛋白质相互作用位点在蛋白质功能研究中发挥着重要作用,文章从蛋白质序列出发,提取相关特征——序列谱、序列谱+信息熵,分别形成多个滑动窗口,以此构造输入特征向量.采用“留一法”生成训练数据集和测试数据集,使用支持向量机构建6种分类器,预测测试集中的表面残基是否是蛋白质相互作用位点,得到了较好的结果,说明了实验方法的有效性和可行性.
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