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对15个籼型杂交水稻亲本进行AFLP分析,结果表明:亲本间遗传距离小,在0.0589～0.3305之间,平均为0.2033.15个亲本按类平均法可聚为两类,Ⅰ类为不育系,Ⅱ类为恢复系.其中Ⅱ类又分为两个亚类,Ⅱ-1不含明恢63血缘、Ⅱ-2全部含明恢63血缘.Ⅰ/Ⅱ-1与Ⅰ/Ⅱ-2间的遗传距离无明显差异,揭示恢复系的遗传基础较一致,这可能是当前的品种不能超过汕优63的重要原因之一.要提高水稻的杂种优势,需丰富亲本的遗传基础,扩大其遗传差异.