【摘 要】
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目的:非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是最常见的慢性肝病之一,包括非酒精性单纯性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver,NAFL)、非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)、肝硬化,最终可能发展为肝细胞癌.本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)构建一个基因共表达网络,以探索N
【机 构】
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温州医科大学附属第一医院感染内科,浙江 温州 325000;金华市中心医院呼吸内科,浙江 金华 321000
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目的:非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是最常见的慢性肝病之一,包括非酒精性单纯性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver,NAFL)、非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)、肝硬化,最终可能发展为肝细胞癌.本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)构建一个基因共表达网络,以探索NASH发生发展的潜在关键通路和基因.方法:数据来自基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中GSE48452和GSE89632两个数据集.使用WGCNA确定与NASH相关的模块.通过功能富集分析,探讨其潜在的生物学功能,并对这些基因进行蛋白质-蛋白质相互作用分析.结果:GSE48452数据集中的黑色模块、GSE89632数据集中的灰色模块与NASH相关最显著.基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析显示目标基因的生物学功能分别集中在脂质降解、核染色体及有机酸的结合.京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路显示基因在过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR)通路富集尤为显著.结论:通过WGCNA分析,确定了与NASH相关的潜在基因[脂蛋白脂肪酶(lipoprotein lipase,LPL)、胸苷酸合成酶(thymidylate synthetase,TYMS)、细胞色素P450家族26亚家族A成员1(cytochrome P450 family 26 subfamily A member 1,CYP26A1)、脂肪酸结合蛋白4(fatty acid-binding protein 4,FABP4)、脂肪酸结合蛋白5(fatty acid-binding protein 5,FABP5)、微染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance protein 2,MCM2)、微染色体维持蛋白5(minichromosome maintenance protein 5,MCM5)、GINS复合物亚单位2(GINS complex subunit 2,GINS2)]及关键通路.这些基因可能参与NAFL到NASH的转化过程,具有一定的诊断和治疗价值.
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