最小Hamilton路算法在蛋白质结构预测中的应用

来源 :生物数学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hhugjl012800

【摘要】

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本文对蛋白质loop结构进行了反向研究,即对由n个残基构成的loop已知其空间结构,求匹配的n个氨基酸残基序列.把loop的3D信息转化为一个加权完全图Kn模型,然后求加权Kn图的最小

【作者】

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史小红许进殷志祥崔觉梅

【机构】

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西安工业大学数理系,北京大学信息科学技术学院,华中科技大学控制与系统工程系

【出处】

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生物数学学报

【发表日期】

：

2009年1期

【关键词】

：

最小Hamilton路蛋白质Loop结构序列顺序加权完全图 Minimum-Hamilton Path Loop structure of Protein

【基金项目】

：

陕西省教育厅专项科研计划项目（08JK313）, 国家自然科学基金资助项目（30570431）

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本文对蛋白质loop结构进行了反向研究,即对由n个残基构成的loop已知其空间结构,求匹配的n个氨基酸残基序列.把loop的3D信息转化为一个加权完全图Kn模型,然后求加权Kn图的最小Hamilton路.这条H路对应与寻找一个氨基酸残基序列,使该序列能够折叠成这个立体结构模型.根据Bayesian定律得到一个加权表,应用对loop的预测问题,取得预期的结果.

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