长白山猪苓与陕西猪苓的菌丝体转录组差异比较分析

来源 :延边大学农学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hulala
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长白山猪苓和陕西猪苓因地理隔离存在种间差异,为阐明长白山猪苓与陕西猪苓菌丝体间的基因表达特征,利用Illumina测序技术对长白山猪苓与陕西猪苓菌丝体的6份样品进行转录组测序,并对2种菌丝体的差异表达基因进行了比较分析。通过对转录组原始数据进行数据质控共得到133 662个Transcript和20 999个Unigene。差异表达分析结果表明:与陕西猪苓菌丝体相比,长白山猪苓菌丝体共有5 881个表达差异基因出现,其中,上调基因有2 616个,下调基因有3 265个。差异基因GO注释分类表明,在细胞组分
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