【摘 要】
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COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子,对植物生长、纤维素含量等有重要作用.本研究通过对茶树基因组数据进行分析,成功的从中鉴定到COBRA基因,并对该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、进化关系、保守结构域、染色体定位等进行生物信息学分析,同时分析了茶树COBRA成员在PEG诱导的干旱胁迫、茉莉酸甲酯处理、盐胁迫、冷胁迫处理中的转录组数据,最后对茶树进行茉莉酸甲酯处理,基于荧光定量PCR技术的表达水平验证.结果表明:茶树COBRA基因有16个家族成员,相对分子质量
【机 构】
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贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;湄潭县茶产业发展中心,贵州 湄潭 564100;贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;贵州大学农业生物工程研究院
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COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子,对植物生长、纤维素含量等有重要作用.本研究通过对茶树基因组数据进行分析,成功的从中鉴定到COBRA基因,并对该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、进化关系、保守结构域、染色体定位等进行生物信息学分析,同时分析了茶树COBRA成员在PEG诱导的干旱胁迫、茉莉酸甲酯处理、盐胁迫、冷胁迫处理中的转录组数据,最后对茶树进行茉莉酸甲酯处理,基于荧光定量PCR技术的表达水平验证.结果表明:茶树COBRA基因有16个家族成员,相对分子质量24807.70～74813.12,等电点5.43～9.14,亚细胞定位显示在细胞膜和细胞外;根据系统进化树将茶树COBRA基因家族分为5类;保守结构域和motif分析发现相同亚家族的基因结构,保守结构域都属于COBRA基因家族;基因表达分析显示COBRA基因在不同茶树部位和胁迫的表达量有不同差异,说明茶树COBRA基因广泛参与茶树生长发育和非生物胁迫响应.实时荧光定量PCR显示经茉莉酸甲酯处理后,3个CsCOBRA基因表达量趋势大致与转录组数据一致,本研究将为进一步开展茶树COBRA基因家族的功能验证和抗逆作用机理研究等提供参考.
其他文献
目的:通过检测干眼豚鼠泪腺组织中的核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)信号通路中相关炎症因子表达情况,初步探讨针刺治疗干眼的抗炎机制.方法:将24只英格兰短毛三花豚鼠(共48只眼),随机分为空白组、模型组、针刺组和假针刺组,每组各6只(12只眼).其中,空白组不做任何处理,模型组、针刺组及假针刺组全程均采用东莨菪碱皮下注射,连续26 d;待干眼动物造模成功后,模型组不做任何治疗,针刺组则分别给予双侧眼周穴位进行针刺治疗2周;假针刺组以钝针头分别给予眼周穴位浅刺激治疗2周;并于实验
目的:探究针刺联合桃红四物汤加减治疗周围性面瘫的临床疗效及对损伤的面神经功能的改善效果.方法:选取符合纳入标准的周围性面瘫患者116例,按照入院顺序随机分为对照组和观察组各58例,对照组采取针刺治疗,观察组在对照组的基础上加用桃红四物汤加减治疗,观察两组临床治疗效果及面部神经改善情况、面神经功能(H-B)量表评分的变化情况.结果:观察组临床总有效率为98.28％(57/58),明显高于对照组86.21％(50/58)(P<0.05);两组额肌、眼轮匝肌、上唇方肌、口轮匝肌4个肌群的运动潜伏期及波动幅度评分
子宫内膜异位症(endometriosis,EM)是临床的常见病和多发病,可引起痛经、性交痛、慢性盆腔痛和不孕等多种症状.卵巢子宫内膜异位囊肿(ovarian endometriotic cyst,OEC)约占EM的80％以上.通过查阅近年的研究文献,发现子宫内膜异位囊肿的治疗方法多样,有口服、针刺、穴位埋线等,但临床多为中西医结合的综合治疗方案.综合的治疗方案可以明显改善OEC患者的临床症状,预防复发、降低中医证候积分和复发率、调节情志、改善抑郁状态、改善卵巢储备功能、提升受孕率.其机制可能是通过降低肿
目的:研究毓麟汤结合督任灸对卵巢早衰临影响,探究治疗效果及安全性.方法:符合纳入标准的105例卵巢早衰患者以随机数字表随机分成观察组(53例)和对照组(52例),对照组采取补佳乐+黄体酮胶囊治疗,观察组在对照组治疗基础上结合毓麟汤及督任灸治疗,比较各组患者临床疗效以及治疗前后生殖内分泌激素水平、中医证候积分、子宫卵巢超声影像学指标变化、治疗安全性情况等.结果:对照组治疗总有效率(84.62％,44/52)低于观察组(96.23％,51/53)(P0.05);治疗前,两组患者促卵泡激素(FSH)、雌二醇(E
目的:探究中药复方益气养荣复经方(YQYR)对环磷酰胺(CTX)诱导的卵巢早衰(POF)小鼠的治疗作用及保护机制.方法:将24只小鼠随机分为空白组、模型组、阳性对照组和YQYR组,每组6只.除空白组外,其余小鼠采用腹腔注射CTX的方法建立化疗诱导的POF小鼠模型.造模成功后第2天开始灌胃,YQYR组小鼠给予中药药液,阳性对照组小鼠给予补佳乐水溶液,空白组、模型组小鼠给予生理盐水,连续灌胃14 d后进行取材.HE染色法观察小鼠卵巢组织病理形态;ELISA法检测小鼠血清FSH、LH、E2、IL-2和TNF-α
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目的:运用网络药理学方法探讨丹参治疗哮喘的作用靶点及通路.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取丹参活性成分及潜在靶点;应用OMIM、GeneCards、TTD、DrugBank和DisGeNET数据库收集哮喘靶点,利用R语言获得丹参治疗哮喘的作用靶点,依据STRING 11.0数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;在Metascape平台进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)分析,运用Cytoscape 3.5.1软件构建丹参治疗哮喘的成分-靶点-通路网
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选择12个代表性的乌龙茶品种(种质)作为供试材料,基于SPME-GC-MS方法获得香气物质表型数据,探索乌龙茶核心种质构建技术流程.当取样比例为25％时,采用多次聚类随机取样法,可以获得\'金牡丹\'、\'铁观音\'、\'悦茗香\'3个核心种质,乙酸苄酯、香叶醇、橙花叔醇、吲哚、芳樟醇及其氧化物等7个核心香气物质.结合SSR标记基因型数据,进行遗传多样性差异分析,核心种质与原生种质2个种群间,在7个表型性状上无显著遗传差异.初步搭建成乌龙茶核心种质构建与遗传评估分析技术流程.