为更好地了解近年来中国暴发的猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)疫情,本研究采集荣昌及其周边地区疑似患有PED的猪小肠上皮组织进行RNA的提取,扩增猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)M基因序列,进行序列分析及M蛋白分子特性研究。结果显示,M基因开放阅读框(ORF)长为681bp,编码226个氨基酸。通过DNAMAN软件及系统进化树分析发现,本试验中PEDV与GenBank中参考毒株的M基因氨基酸同源性在96.0%以上,其中与广东毒株CH/SD-M/2012株亲缘关系最为相近,同源性高达96.9%,表明M基因相对比较保守。通过M蛋白同源建模及功能预测发现,M蛋白晶体模型同SARS冠状病毒nsp14-nsp10复合体5c8s.1.A及NAD激酶Ⅰ2i1w.1.B模型序列相似性为27.69%、15.07%;其高级结构中在第110—113、118—125、132—136、140—145、147—152、154—157、160—173位氨基酸处存在7个α螺旋,在第98—100、102—107、135—137、139—145、149—154氨基酸存在5个锌指结构配体,M蛋白为PEDV病毒基因组复制酶的多聚蛋白。