【摘 要】
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八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素生物合成过程中催化无色的八氢番茄红素形成有色的ζ-类胡萝卜素的关键酶。本文选取公开发表的PDS及通过在NCBI数
【机 构】
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辽宁师范大学生命科学学院,辽宁省植物生物工程重点实验室;
【基金项目】
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辽宁省教育厅重点实验室项目(2009S061)
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八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素生物合成过程中催化无色的八氢番茄红素形成有色的ζ-类胡萝卜素的关键酶。本文选取公开发表的PDS及通过在NCBI数据库中搜索得到的43条来自于不同物种的PDS的氨基酸序列进行分析。通过CDD在线软件预测每条氨基酸序列保守结构域,结果表明,所选取序列均包含一个NAD(P)-binding domain保守结构域,其长度为51个氨基酸,不同物种保守结构域中氨基酸的突变集中在8个不同的位置上;利用MEGA等软件进行多序列比对后构建系统进化树,可以看到不同物种的PDS蛋白清晰地分类到各自的类群内,和传统的分类学结果一致,表明所有不同分支的PDS蛋白都是单系同源,并不存在物种间的水平基因转移。
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