基于转录组测序分析外源蔗糖对紫萍的淀粉合成基因表达的调控

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woshigezuiren
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为了研究紫萍(Spirodela polyrrhiza)响应外源蔗糖的机制,探究紫萍在外界高、低浓度蔗糖影响下差异表达的基因,本试验在培养紫萍的B5培养基中分别添加1%和3%的蔗糖,通过Illumina高通量测序平台对紫萍进行二代转录组测序,对差异表达的基因进行GO及KEGG分析。测序共获得306 168 360条高质量reads(Q30>94%)。样品间共筛选出428个差异表达基因,其中上调表达306个,下调表达112个。这些差异表达基因富集在15条KEGG代谢通路中,在淀粉与蔗糖代谢途径中发现了5个差异表达基因,其中腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶作为淀粉合成途径的核心酶,表达量大且上调,这与在两种蔗糖浓度培养下紫萍中实际测定的淀粉含量的差异是一致。研究结果丰富了紫萍转录组数据,为蔗糖调控植物生长发育的分子机制提供了理论依据,也为进一步研究紫萍淀粉合成关键基因功能及淀粉积累机制奠定基础。
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