【摘 要】
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为给优异樱花种质的保存和利用提供理论依据，对47份樱花种质资源进行了RAD简化基因组测序，挖掘高一致性的群体SNP，应用RAxML、ADMIXTURE、GCTA、PopGenome和Arlequin 3.0等生物信息学软件进行了系统进化树构建、基因分型分析、主成分分析和核苷酸多样性分析。经过基因型完整性过滤和紧密连锁位点筛选后，共获得79 667个高一致性群体SNP。系统进化、遗传结构和主成分聚类
【基金项目】
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国家林业和草原局林业科技发展中心项目（KJZXSA2019037）； 湖南省重点研发计划（2017NK2251）共同资助；
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为给优异樱花种质的保存和利用提供理论依据，对47份樱花种质资源进行了RAD简化基因组测序，挖掘高一致性的群体SNP，应用RAxML、ADMIXTURE、GCTA、PopGenome和Arlequin 3.0等生物信息学软件进行了系统进化树构建、基因分型分析、主成分分析和核苷酸多样性分析。经过基因型完整性过滤和紧密连锁位点筛选后，共获得79 667个高一致性群体SNP。系统进化、遗传结构和主成分聚类分析结果基本一致，47份种质资源分为8个类群，各类群的核苷酸多样性（π）和平均期望杂合度（He）分别为Ⅰ：0.128 19,0.119 94；Ⅱ：0.139 64,0.130 55；Ⅲ：0.215 5,0.164 73；Ⅳ：0.086 82,0.061 22；Ⅴ：0.095 49,0.069 73；Ⅵ：0.191 22,0.106 1；Ⅶ：0.168 5,0.158 78；Ⅷ：0.290 98,0.183 43。类群Ⅳ与Ⅴ之间的遗传分化程度最高（FST=0.461 289），其次是类群Ⅳ与Ⅵ（FST=0.456 958），类群Ⅶ与Ⅷ之间的分化程度最低（FST=0.097 613），各类群之间的遗传分化均处于中等及以上水平。基因分型结果显示，单一遗传组分的个体有29个（61.70%），含有2或3种遗传组分的个体有18个（38.30%），潜在的种间自然杂交个体有4个。樱花种质资源的遗传多样性丰富，8个类群之间存在明显的遗传分化。通过基因型分析，明确了种间自然杂交后代和人工杂交品种的遗传组分，初步探讨了亲本来源。
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