先天性心脏病新生儿血浆circRNAs芯片数据的生物信息学分析

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目的 利用高通量检测技术探讨新生儿先天性心脏病(CHD)的发病机制。方法 将CHD新生儿血清与正常健康新生儿血清各3份进行配对分析,用微阵列探针进行环状RNA(circRNAs)检测。结果 共检测到1 711个circRNAs,其中差异表达的circRNAs 375个,在CHD新生儿血清中表达上调的circRNAs 115个,下调的circRNAs 260个(FDR>2,P<0.05)。通过美国Arraystar公司的微小RNA(miRNA)结合位点预测软件,该研究对每个差异表达的circRNA预测5个高匹配值的miRNA结合位点,375个差异表达的circRNAs预测结合了1 546个miRNAs对14个miRNAs的靶基因进行信号通路分析,其中富集总分位于前3位的通路局灶性黏连、肌动蛋白细胞骨架调节、血管平滑肌收缩均与CHD的病理相关。通过hsa_circ_091419/miR-145/mRNA的网络图构建,该研究预测CHD相关的靶基因其34个,包括hsa-miR-145-3p的靶基因ITGB8。结论 CHD的发病机制可能与circRNA和miRNA的上调或下调及circRNA-miRNA的共表达密切相关,具体涉及多种途径和多种细胞分子生物学过程的调控。
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