基于生物信息学分析PKM2在肺腺癌中的表达及临床意义

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目的:通过生物信息学方法分析M2型丙酮酸激酶(pyruvate kinase M2,PKM2)在肺腺癌(lung adenocarci-noma,LUAD)中的表达及临床意义.方法:利用Oncomine和TCGA数据库荟萃分析PKM2 mRNA在LUAD组织和正常肺组织中的表达差异,验证HPA数据库中PKM2蛋白表达;分析该基因与LUAD患者生存的关系;LinkedOmics和Metascape平台做PKM2与LUAD临床病理特征及KEGG通路分析;String-DB网站构建蛋白互作(protein-protein in-teraction,PPI)网络.结果:LUAD组织中PKM2 mRNA表达水平是正常肺组织的1.95倍(P<0.05).免疫组化结果显示PKM2蛋白在LUAD组织中高表达.PKM2表达与LUAD的病理分级、T分期和N分期呈正相关(均P<0.05),且高表达者总生存率低于低表达者(P<0.001,HR=2.56).PKM2正相关表达基因主要与糖酵解、癌症中央碳代谢、HIF-1等信号通路有关.结论:PKM2在LUAD组织中高表达,且与LUAD患者不良预后相关,有望成为LUAD诊断和治疗的有效生物标志物.
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