基于大花四照花转录组的SSR分布特征分析及引物开发

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:JGTM2000
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大花四照花是极具开发价值的观赏性植物资源,合理开发和可持续利用其种质资源十分必要.本研究以第二代高通量测序的转录组测序数据为基础,通过MISA软件对大花四照花转录组的SSR位点进行筛选和分析.结果 显示,共获得30 401个SSR位点,SSR的分布频率为22.90%,平均每2.88 kb出现一个SSR位点;大花四照花SSR位点的重复类型以单核苷酸重复和二核苷酸重复为主,各占所有位点的45.73%和37.98%;重复基序类型较为丰富,共有196种,其中单核苷酸A/T重复类型的数量最多.SSR的重复次数主要以5~30次为主,长度分布在10~87 bp之间,平均长度为17.39 bp.随机选取48对设计的SSR引物进行PCR检测,共有35对引物能扩增出单一、清晰的条带,有效扩增率为72.92%.大花四照花转录组中SSR位点的数量和种类比较丰富,分布密度较大,初步开发的SSR引物扩增率较好,具有潜在的多态性,可为后期的种质资源开发与保护、遗传连锁图谱的构建及分子标记辅助育种等提供基础.
其他文献
为分析11份柑橘种质材料的遗传多样性,本研究以7份沙糖橘种质以及4份其他柑橘种质为试验材料,利用SRAP分子标记进行分析,并用UPGMA法进行聚类.结果表明:160对引物组合筛选出2
叶是植物开展光合作用的主要器官,也是某些作物的主要产物器官.因此,叶的大小将在很大程度上决定作物的产量.近年来,人们对叶大小发育的调控机制已经开展了大量的研究并取得
创新是一个民族、国家发展和富强的基础,尤其是尖端创新.本文对尖端创新的内容:理论创新、技术创新和管理创新的现状进行了分析,指出目前我国的创新总体处于“量变”积累阶段,
本文在对65次全球性的生物事件分析的基础上,总结出了灭绝事件总是发生在旧的大年(相当于一个完整的气候变迁周期)的冬末;而辐射事件则总是出现在新的大年的春季这一论点,指出
本文简要地阐述了地球科学的起源、发展、演化趋势及与人类生存环境的关系等重大理论和实践问题,指出地球科学的研究和发展,必须加强全球视野的同时,更应具备超越实体性存在整
现代旅游业及旅游实践的深入发展和对旅游资源开发的多元需求,客观上为旅游地学学科的萌生及发展提供了千载难逢的机遇,“旅游地学”学科概念一经提出,便显现出了该学科的强大生
会议
病毒能够激活宿主的防御途径,诱导宿主大量基因表达.辅助成分-蛋白酶(helper-component protease,HC-Pro)是RNA病毒编码的基因沉默抑制子,关于HC-Pro诱导植物内源基因表达的
有人说,设计作为人类发展的一个重要因素,既能为人类创造出一个更加美好的世界,也可能成为人类自我毁灭的绝路,因而,设计的设计——设计批评就显得不是可有可无的,它可以为
CRISPR/Cas9系统是应用最为广泛的基因编辑系统,由核酸酶Cas9和一个单分子向导RNA (single guide RNA,sgRNA)组成,共同介导了目标位点序列的切割,造成DNA双链断裂,从而激活细
壳斗科植物叶片富含色素、多糖及多酚类等物质,采用常规CTAB法、SDS法虽然总DNA产率较高,但多酚类和多糖污染严重;采用进口试剂盒提取,虽能有效降低总DNA中多糖多酚类物质的