基于关键致病基因筛选的肝癌临床预后及中药靶向治疗的生物信息学研究

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通过生物信息学方法筛选肝癌关键致病基因,探究其表达水平、致病机制、免疫浸润、突变及预后情况,并进一步挖掘潜在的可用于肝癌靶向治疗的中药。通过数据集GSE19665分析正常和肝癌组织的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs);对DEGs进行GO和KEGG分析,构建DEGs蛋白互作网络并筛选肝癌发病关键基因;对关键基因进行突变、免疫浸润、表达及预后分析;挖掘潜在的治疗肝癌的中药和天然活性成分。筛选得到显著性DEGs 159个,主要涉及免疫、炎症反应,参与p53、mTOR等信号通路;筛选出10个关键基因,CDC20等四个基因在肝癌组织的表达显著升高,高表达组患者的总生存期明显降低;关键基因突变患者的总生存期和无病生存期均明显降低;关键基因表达与免疫细胞浸润密切相关;以关键基因为靶点筛选得到36种中药和105种中药活性成分。本研究鉴定出了肝癌关键致病基因,其异常表达与肝癌的不良预后、免疫细胞浸润密切相关,挖掘出潜在的治疗肝癌的中药及其活性成分,研究结果可为肝癌的诊断、治疗及预后提供科学依据。
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