【摘 要】
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背景:单细胞RNA测序作为新一代mRNA测序方法,经过十几年的发展已经逐渐成熟并逐步应用于眼科研究.目的:综述近年来单细胞RNA测序的发展及其在眼科学领域的应用及进展.方法:利用计算机检索PubMed,Sciencedirect及Web of Science数据库中相关文献,以“Single-cell RNA-seq,retina,cornea,gene marker”为英文检索词进行检索,检索时限为2006-01-01/2021-01-31,通过阅读和分析对文献进行初步筛选,以排除重复文献和低相关性文献
【机 构】
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南方医科大学第二临床医学院,广东省广州市 510580;中山大学第六附属医院眼科,广东省广州市 510630;南华大学,湖南省衡阳市 421001;南方医科大学深圳医院眼科,广东省广州市 518101
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背景:单细胞RNA测序作为新一代mRNA测序方法,经过十几年的发展已经逐渐成熟并逐步应用于眼科研究.目的:综述近年来单细胞RNA测序的发展及其在眼科学领域的应用及进展.方法:利用计算机检索PubMed,Sciencedirect及Web of Science数据库中相关文献,以“Single-cell RNA-seq,retina,cornea,gene marker”为英文检索词进行检索,检索时限为2006-01-01/2021-01-31,通过阅读和分析对文献进行初步筛选,以排除重复文献和低相关性文献,最终纳入80篇文献进行结果分析.结果 与结论:①单细胞RNA测序是在单细胞水平上,对基因组、转录组和表观基因组进行高通量测序分析的技术,与传统的测序方法相比,其可进一步应用于研究细胞之间的差异,解释细胞亚型和特定表达的基因,探索疾病发生、发展和耐药机制,为免疫治疗提供新的靶点.②目前单细胞RNA测序有很多分支,如STRT-seq,Smart-seq,CEL-seq,MARS-seq,Cyto-seq,Drop-seq,inDrop-seq及Seq-Well等,这些技术各有其优势和应用领域,例如STRT-seq仅在5\'端且不具有链特异性,然而Samrt-seq转录覆盖区域为全长.③在眼科学领域中,单细胞RNA测序主要应用于角膜和视网膜的研究,在眼细胞新亚型的识别以及眼科疾病的诊断和潜在的免疫治疗中均有新的科学发现,少数应用于晶状体疾病和葡萄膜黑色素瘤的研究.④单细胞RNA测序技术在角膜领域的研究,主要是关于圆锥角膜疾病、角膜上皮细胞基因的相关表达.其中,Notch1和PLLP基因被证实与圆锥角膜的发病机制相关;角膜基底细胞中Krt15,Fzd7,Krt17基因表达增高,而基底上皮祖细胞中Sox9,Actn1,Anxa3表达为主.此外,视网膜组织是一种易于获取并观察的组织,单细胞RNA测序技术近年来多被应用于研究正常视网膜组织细胞亚型,以及视网膜相关疾病,如年龄相关性黄斑病变及视网膜母细胞瘤等疾病的基因表达研究.⑤单细胞RNA测序技术可以准确反映单个细胞的基因表达情况,近年来多用于角膜和视网膜的基因表达、细胞亚型与信号通路研究,在未来的眼科疾病治疗中将发挥重要的作用.
其他文献
目的:非正常足型的发展会对儿童的生长和生活带来不利的影响,儿童非正常足型的早期诊断有利于对儿童足型的及时矫正.文章对文献中儿童足型分类的方法进行总结与回顾,以期为临床医生在儿童非正常足型的预防与矫正策略的研究上提供有价值的参考信息.方法:在万方、维普、中国知网、Web of Science和PubMed数据库中对儿童足型分类的相关文献进行检索,并对儿童足型分类的方法进行分类、归纳与系统评价.结果:①最终纳入12篇文献,其中儿童足型分类方法主要包括足印指数法、放射学评估法、临床检查法和人体测量学检查法共4种
背景:颅脑外伤后形成的反应性星形胶质细胞可能对神经干细胞向神经元分化产生不利影响,因此研究颅脑外伤后反应性星形胶质细胞对神经干细胞分化的调节作用及其机制对促进神经功能恢复具有很大临床应用前景.目的:探讨反应性星形胶质细胞对神经干细胞向神经元分化的影响.方法:体外培养SD大鼠星形胶质细胞,分为对照组和脂多糖刺激组,干预3 d后,采用PCR、ELISA、Western blot检测星形胶质细胞中集落刺激因子1的表达;体外培养SD大鼠原代神经干细胞,在成神经元诱导培养基中加入星形胶质细胞条件培养基共培养3 d,
背景:国内外多项临床研究均表明非血缘脐血移植相对于外周血干细胞或骨髓移植,不仅具有较低的移植物抗宿主病发生率,并且疾病复发率也明显降低,具有较强的移植物抗白血病效应,是临床上分离移植物抗宿主病和移植物抗白血病效应的模型之一.非血缘脐血移植后免疫细胞如何分化,为何具有较强的移植物抗白血病效应,目前机制尚不清楚.目的:回顾性分析非血缘脐血移植患者长期临床随访资料,并探讨非血缘脐血移植后优势细胞亚群及分化、相关活化与抑制分子的表达情况,进一步探讨非血缘脐血移植后移植物抗宿主病与移植物抗白血病效应分离的机制.方法
背景:临界骨缺损的修复一直是困扰临床外科医生的关键问题,骨组织工程研究提供了解决该问题的新思路.如何加快组织工程骨的血管化,进而促进种子细胞的成骨分化是骨组织工程研究中的关键问题.目的:探讨血管内皮细胞和脂肪干细胞联合培养体系与部分脱蛋白生物骨构建组织工程骨修复骨缺损的能力.方法:体外构建3种组织工程骨:部分脱蛋白生物骨+血管内皮细胞、部分脱蛋白生物骨+脂肪干细胞、部分脱蛋白生物骨+脂肪干细胞+血管内皮细胞(血管内皮细胞:脂肪干细胞比例为1:1),以单纯部分脱蛋白生物骨为对照组.取18周龄SD大鼠60只,
背景:在研究骨髓间充质干细胞增殖的基础上揭示其分化机制是防治骨质疏松症研究的热门课题之一.目的:探讨龟鹿二仙胶含药血清诱导骨髓间充质干细胞成骨分化以防治骨质疏松症的分子机制与激活细胞外信号调节激酶1/2/E26转录因子1信号通路因子之间的相关性.方法:购买商品化第3代SD大鼠骨髓间充质干细胞,根据加入不同成分培养基分为胎牛血清组、空白血清组、龟鹿二仙胶含药血清组、经典诱导组以及通路抑制剂组、龟鹿二仙胶含药血清+通路抑制剂组,根据分组条件进行成骨诱导分化,每3 d换液1次,干预7 d时采用碱性磷酸酶活性检测
背景:碱性成纤维细胞因子作用于成纤维细胞时,可以通过激活Wnt信号诱导其增殖,但在其作用于根尖牙乳头干细胞的研究中,是否也可以激活Wnt/β-Catenin信号通路,以及激活该通路后对根尖牙乳头干细胞的生物学活动有何影响尚不清楚.目的:探讨碱性成纤维细胞因子对根尖牙乳头干细胞增殖的调控作用.方法:通过酶消化法和有限稀释法克隆化培养人根尖牙乳头干细胞;以15μg/L碱性成纤维细胞因子作用根尖牙乳头干细胞2 d,采用RT-PCR、Western blot检测β-Catenin、TCF1、TCF3、LEF1 m
背景:脊髓损伤的临床表现与损伤的严重程度和部位相关,尽管对脊髓损伤的研究已经持续了多年,但目前仍然没有有效的治疗方法来恢复受损脊髓的功能.目的:对星形胶质细胞的特征、近年来有关反应性星形胶质细胞活化的研究以及相关治疗策略进行综述.方法:在PubMed数据库中,以“spinal cord injury,astrocyte”为关键词进行检索;在万方数据库、CNKI中以“脊髓损伤,星形胶质细胞”为关键词进行检索,检索时限为2010年1月至2020年10月,按纳入和排除标准进行归纳总结,排除了与研究目的无关、年代
背景:骨髓间充质干细胞是一种具有增殖能力强、多向分化潜力的成体多能干细胞,且不存在伦理和排斥反应等问题,已在相关实验中证实其治疗脊髓损伤的有效性,成为最有前途的治疗脊髓损伤的种子细胞.目的:综述多种方法联合骨髓间充质干细胞移植治疗脊髓损伤的最新研究进展.方法:检索1999年1月至2020年10月中国知网、万方及PubMed数据库相关文章,检索词为“骨髓间充质干细胞,细胞移植,脊髓损伤”和“bone marrow mesenchymal stem cells,cell transplantation,spi
背景:脂肪干细胞含量丰富、易获取,已成为再生医学领域备受欢迎的种子细胞之一.脂肪干细胞来源外泌体是脂肪干细胞与其他细胞间通讯的桥梁与纽带,具有调节免疫和炎症反应、促进损伤细胞自我修复等作用,被认为是脂肪干细胞的可替代治疗方案.目的:对脂肪干细胞来源外泌体调节组织再生的研究进展及面临的挑战作一综述.方法:通过检索CNKI、万方数据库及PubMed、Web of Science数据库相关文章,以“脂肪来源干细胞”“脂肪干细胞”“外泌体”为中文检索词,以“adipose-derived stem cell”“a
背景:干细胞以旁分泌或远距分泌的方式对炎症反应产生调节作用,是干细胞移植治疗疾病的主要机制之一.移植的干细胞分泌大量生物活性分子,如转化生长因子β、前列腺素E2、白细胞介素10和肿瘤坏死因子α-刺激基因-6蛋白(tumor necrosis factorαstimulating gene-6 protein,TSG-6)等,影响单核/巨噬细胞从促炎M1表型转化为抑炎M2表型,协调促炎和抗炎因子的平衡,是其调节炎症反应的重要机制,而目前干细胞分泌因子促进单核/巨噬细胞亚型转化的作用机制尚不明确.目的:探讨人