为了研究生物炭施用对节水灌溉稻田甲烷排放的影响机制，采用荧光定量PCR方法研究了不同生物炭施用水平对节水灌溉稻田土壤中产甲烷菌基因（mcrA）与甲烷氧化菌基因（pmoA）丰度的影响。研究结果表明，生物炭施用能够提高节水灌溉稻田土壤pmoA和mcrA基因丰度，乳熟期高量生物炭添加效果更显著，而中等水平生物炭添加在分蘖期和拔节孕穗期效果更显著。控制灌溉在分蘖期和乳熟期能够显著增加稻田土壤pmoA和mcrA基因丰度。控制灌溉在分蘖期和乳熟期能显著增加pmoA/mcrA比值（p<0.05），且施加生物炭能显著增加乳熟期稻田土壤pmoA/mcrA比值（p<0.05），即控制灌溉和生物炭施加能够提高土壤的甲烷氧化能力，减少稻田土壤甲烷的排放。综上所述，生物炭和控制灌溉在一定程度上均能提高稻田土壤中甲烷氧化菌和产甲烷菌基因丰度，同时对于产甲烷菌的促进作用小于甲烷氧化菌，通过改变土壤中pmoA和mcrA基因的数量和比例可以有助于调控稻田土壤甲烷的排放。