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一、柠檬疮痂病
症状及危害：柠檬疮痂病主要侵染叶、梢、果的幼嫩组织。受害叶片初期出现油渍状小点后呈蜡黄色病斑，随着叶片生长，病斑扩大并逐渐木栓化，病斑周围叶片组织作圆锥状向背面突起，叶正面凹陷，病斑散生或连片，为害严重时常引起叶片畸形扭曲。新梢上的病斑与叶片上的相似，但突起不明显。果实受害后，果皮上常长出许多散生或群生的瘤状突起，果实小畸形、易落。疮痂病危害叶片，枝梢和果实，引起落叶、落果，使产量和品质降低。
病原及发病规律：疮痂病菌属半知菌亚门痂圆孢属的柑桔痂圆孢菌，其分生孢子梗呈圆筒形，该病以菌丝体在病枝叶上越冬，翌年春，当气温达15℃以上和多雨多雾高温时，病斑上产生分生孢子。分生孢子借风、雨传播侵入春梢嫩叶、梢和幼果。本病只侵染感病品种的幼嫩组织，通常在新梢幼叶尚未展开前易感病，谢花后不久的幼果也最易感病。
温度和湿度影响本病的发生流行，本病发生的温度范围为15～24℃，最适温为20～21℃，当温度超过24℃时停止发生，在适温范围内，阴雨连绵或大雾重露天气，有利于病害的发生与流行，此病在瑞丽因气候1～4月春旱严重，5～6月高温，不禾惦痂病发生，因此春梢、早夏梢发生较少，基本不产生危害，而7～9月的阴雨、多雾天气，极易造成在柠檬秋梢、柠檬夏果、秋果上的流行危害。
防治方法
1、药剂防治：药剂保护的重点是嫩叶和幼果。防治春梢的疮痂病，应在春梢新芽萌发至芽长4mm时即开花前喷药，保护幼果，应在谢花三分之二时，或发病初期喷药。药剂种类可选用：0.5～0.8％倍量式波尔多液，50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液，70％甲基托布津可湿性粉剂800～1000倍液，50％大富生可湿性粉剂800～1000倍液，75％百菌清可湿性粉剂800～1000倍液，25％溃疡灵800～1000倍液，喷药次数应根据病情而定，一般隔5～7天喷一次，喷2～3次。
2、冬季清园：结合冬季修剪清园，剪除病枝病叶，同时清除地面枯枝落叶，消灭越冬病源。
3、加强肥水管理，使新梢柚生整齐健壮，增强抗病力。
二、柠檬炭疽病
症状及危害：此病在幼苗、幼果、果实贮藏期发生危害。叶片受害，在叶片上有叶斑型和叶枯型两种，叶斑型病斑多发生在叶边缘或叶尖，多为半圆或近圆形，病部稍下凹，浅灰褐色，与健部界限明显，病斑上常出现排成同心轮纹状的黑色小粒点，(病菌分生孢子盘)。潮湿则变为红色小点，叶枯型多在春季发生，病部多在叶尖，初期病斑为暗绿色，如开水烫伤状，后迅速扩大变为黄褐色，有病组织多呈“V”字形枯死，叶上多生红色小点，常造成叶片腐烂脱落。枝梢一种为灰白色，一种为淡褐色。其上散生黑色小点。幼果受害，初为暗绿色油渍不规则病斑，后扩大至全果。病斑凹陷，长出白色霉层和土红色小点，后使果实腐烂。或僵果挂在树枝上，近成熟果受害后，有干疤、渍痕和软腐三种。
炭疽病危害枝梢、叶片、果实和苗木，常引起落叶、落果、枝梢枯死和苗木死亡。
病因及发病规律：柠檬炭疽病病菌属半知菌亚门有刺炭疽孢属的胶孢炭疽菌，分生孢子长椭圆形。属潜伏侵染性病害。健康组织一般不会发病，但发生严重冻害，或早春低温潮湿，夏秋高温多雨季节，或由于耕作、移栽、长期积水，施肥过多等造成根系损伤，或肥力不足、干旱、虫害严重、农药药害、空气污染等造成树体衰弱，或由于偏施氮肥使植株大量抽发新梢或徒长枝，均能助长病害发生。病菌在病部组织越冬，分生孢子借风、雨和昆虫传播，从伤口、气孔和皮孔侵入，在整个柠檬生长期均可侵染。通常3～4月开始发病，夏梢发病多，最适发病条件是21～28℃的气温条件。
防治方法
1、改善柠檬园管理：做好肥水管理和防虫、防冻等工作，避免造成树体机械损伤，保护健壮的树势。剪除病虫枝、衰弱枝和徒长枝，清除地面落叶，集中烧毁，修剪后在伤口处涂上70％甲基托布津可湿性粉剂100～200倍液。
2、喷药保护：一般树势衰弱的柠檬园在每次抽梢时喷药1次，幼果期喷药2～3次，间隔10～15天，选用的药剂有0.5:1:100波尔多液，0.5波美度的石硫合剂。发病后选用700甲基托布津可湿性粉剂、或50％多菌灵可湿性粉剂500～800倍液，或50％大富生可湿性粉剂600～1000倍液喷雾。
三、煤烟病
症状及危害：此病发病初期在叶、梢、果表面出现暗褐色点状小霉斑，后继续扩大成绒毛状黑色或灰黑色霉层。后期霉层上散生许多黑色小点或刚毛状突起物，呈烟煤状，煤层易剥离，剥离后枝、叶、果表面仍为绿色。主要危害叶片、枝条、果实，严重影响光合作用和果实品质，花少，果小。
病原及发病规律：本病由多种真菌引起，以菌丝体或分生孢子器在病部越冬，来年春季由霉层飞散孢子，落在蚜虫、粉虱或蚧壳的分泌物上，弓!起发病。借风雨传播，在栽培不良，枝叶过密，湿度大，蚜虫或蚧壳虫发生严重的柠檬园发病严重。
防治方法
(1)及时防治蚜虫、蚧壳虫及粉虱类害虫，清除发病条件。
(2)做好冬季清园，合理修剪，改善通风透光条件，做好排水工作，降低果园湿度。
(3)药剂防治：发病初期选用50％甲基托布津可湿性粉剂500～800倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂400倍液，或5％菌毒清500倍液，或0.3～0.5等量式波尔多液或用1:1:300倍尿洗合剂(即尿素1kg，洗衣粉1kg，水300kg)进行防治。
(四)流胶病症状及危害：流胶病是柠檬的主要病害，受害植株的主杆和主枝发生流胶，林势衰弱，树皮坏死，树叶枯黄，产量降低，严重时植株部分枝条及整株死亡。流胶病病斑形状不规则，病部树皮呈褐色水渍状，常有裂口和流胶，干燥时不流胶，病部枝条叶片黄化，无光泽，严重时全株黄化。
病原及发病规律：流胶病由真菌类的疫霉菌引起，病菌在病部组织中进行越冬，该病全年均可发生，但以6～10月份发病重。一般病菌从伤口侵入，高温高湿时发病重，土壤粘重，排水不良，树冠郁闭，施氮肥过重等，均有利于发病，一般幼树发病轻，老树发病重。
防治方法
1、选用抗病的砧木品种枳或红桔，尽量不用香橼做为砧木。
2、建园时选择地势比较高，排水良好的园地。
3、加强栽培管理，增施有机肥，合理进行间作和修剪，增加柠檬园通风透光，冬季进行树杆涂白。
4、加强对天牛和吉丁虫等树干害虫的防治。
5、当病害发生后，用刀将病部的坏死部分刮除，深度可达木质部表层。然后涂50％甲基托布津可湿性粉剂100倍稀释液，或50％多菌 灵可湿性粉剂100倍稀释液，20％甲霜铜(甲霜灵)200～400倍液，冬季涂石硫合剂药渣防治效果较好。
五、溃疡病
症状及危害：叶片发病时，在叶背出现针头大小淡黄色或暗绿色油渍状斑点，后扩大成灰褐色圆形病斑，叶片正反面隆起，随后病部中央破裂木栓化，呈灰白色的火山口状，病斑周围有一暗褐色油腻状和黄色晕环。果实和枝梢上的病斑与叶片相似，但病斑的木栓化程度更为严重，山口状开裂更为显著。
溃疡病危害嫩叶、嫩梢和幼果，常引起落叶落果，枝梢枯死，产量降低，果实品质下降。
病原及发病规律：该病为国内外植物检疫对象，柠檬发病严重，病原为细菌，由野油菜黄单脆杆菌所致，细菌为短杆状，两端圆，病菌在病部组织内越冬。翌年温度适宜，湿度高时，病菌从病斑中溢处，借风、雨、昆虫和枝叶交叉接触传播。远距离的传播则主要通过带菌苗木、接穗和果实。病菌从伤口，气孔和皮孔侵入，此病发生的温度范围为20～32℃，最适为25～30℃，高温高湿天气是流行的必要条件。暴风雨给寄主造成大量伤口，有利于病菌的传播和侵入。
防治方法
1、严格实行植物检疫：柠檬苗木、接穗、砧木、种子和果实的调动要按规定严格实施检疫，防止溃疡病的传播蔓延。保护区发现病株、病苗立即烧毁。
2、培育无病苗木，建立无病苗圃，选择隔离条件好的地域建立苗圃。
3、减少果实和叶片损伤，柠檬园的四周可采取营造防风林，以减少柠檬园风速，及时防治潜叶蛾等害虫，减少虫伤，及时剪除病枝病叶，清除枯枝落叶落果，减少病原。
4、喷药保护嫩梢和幼果。苗木和结果的幼龄树以保梢为主，在春、夏、秋梢萌发后20～30天各喷1～2次药剂进行保护。结果树以保果为主，在谢花后10天、30天、50天各喷药1次。选用的药剂有消菌灵1000～1500倍液，或77％可杀得800～1000倍液，或用0.3～0.5％等量式波尔多液，12％的绿乳铜800～1000倍液，40％氢氧化铜600倍液，25％叶枯灵500～1000倍液，1000×10～6农用链霉素等防治。
六、裂皮病
症状及危害：发病植株的症状一般是砧木部树皮纵向开裂，部分树皮剥落，树冠矮化，新梢小而弱，叶片变小，叶脉及其附近绿色而脉间叶肉黄色，病树开花多，落花落果严重，产量下降，小枝枯死，甚至整株未老先衰。一般带病苗木在苗期无症状，定植4年以后才表现，主要危害柠檬主杆下部或嫁接口部位。
病原及发病规律：病原是一种类病毒，该类病毒没有蛋白质外壳的游离低分子核酸，对各种理化的作用均表现有高度的稳定性，病原通过汁液传播，在柠檬园主要通过修剪和嫁接传播，亦可通过农事操作工具(如修枝剪。嫁接刀，锄头等)或手接触病原，再接触健株而传播。种子不带病，目前尚未发现昆虫对该病传播。
防治方法
1、选择无病母树釆穗繁殖或利用脱毒苗，选用耐病砧木进行嫁接，如红桔等。
2、对修剪、嫁接用的剪、刀等工具，要用10～20％漂白粉溶液浸泡或擦洗消毒，然后用清水冲洗干净，以防病菌传播。
3、苗木除萌或果园抹牙放梢时，应拉扯去芽的方法代替手指抹芽，以免手上沾污的病汁液传播。
4、发现个别或小量病株时，应及时挖除并烧毁，以控制病害蔓延。
七、脚腐病
症状及危害：脚腐病，又名裙腐病，是一种根颈病害。是柠檬的主要病害之一，常在根颈和主根皮层发生危害。病部树皮腐烂呈褐色，有水渍状，有酒糟味，常流出胶质。在高温多雨，土壤排水不良的条件下，病斑迅速扩大。在干燥条件下，病部开裂变硬，病、健部分界明显，初期危害树表皮，后扩展至形成层以至木质部。病斑向纵横方向扩展，向上蔓延至主干距地面约20cm处，向下蔓延至根群，横向可环绕主干一周，使树皮变黄脱落，最后导致植株死亡。主要危害根颈和根群。
病原及发病规律：病原为疫霉属病菌，包括寄生疫霉、柑桔褐疫霉、棕榈疫霉、恶疫霉和甜瓜疫霉等五种。病原以菌丝体在病部组织中越冬，靠雨水传播。此病于4月中旬发病，以7～8月份为盛。高温高湿、土壤排水不良、果园间作高秆作物、栽植密度过大，树冠郁闭，栽植过深(嫁接口埋入土中)、树皮受损伤等，均会促发此病。香橼砧嫁接的柠檬最易感病。
防治方法
1、选用枳砧、红桔砧进行嫁接育苗，提高嫁接部位。
2、种植时栽植不宜过深，嫁接口应露于土外。
3、增施有机肥改良土壤，搞好开沟排水，避免种植高杆作物。
4、病树在刮去病部后，再隔4～5cm处纵割一条深达木质部的割口，涂药防治，用药可选取20％甲霜灵100～200倍液，50％甲基托布津500倍液或5度石硫合剂。
八、树脂病
症状及危害：由于病害所发生时期和危害部位的不同，树脂病有蒂腐病、褐色蒂腐病和黑点病等类型。此病导致树干枝条干枯和流胶，尤其是在冻后受害严重，一般造成减产，严重时会造成树死园毁，树干受害后，病部皮层呈灰褐色或深褐色，水渍状，随即流胶。胶液初为淡褐色，后为褐色，皮层坏死干枯而微翘。死皮有时剥落，使木质部裸露；有时病部干枯，无显著流胶，皮层为红褐色，干枯略下陷，微有裂缝，但不立即剥落。在病健部交界处有一条黄褐或黑褐色菌隆起界线。病部皮层和外露的木质部上有黑色小粒点，木质部变成浅灰褐色。幼果、新梢和叶片受害时，表面生出很多隆起的黑褐色或黄褐色硬胶质小点，使表面变得粗糙，好像附有沙粒一样，故又称为沙皮病。成熟果实或贮藏果实感病后，环绕蒂部出现水渍状淡褐色病斑，渐变为深褐色，并逐渐向基部扩展，边缘呈波纹状，最后全果腐烂。树脂病主要危害主杆、枝、叶以及果实。
病原及发病规律：柠檬树脂病病菌属真菌子囊菌亚门病害。病菌以菌丝体或分生孢子器在病部组织中越冬。分生孢子借风、雨、昆虫等传播。从树体伤口侵入，故伤口是病害流行的先决条件。栽培管理差。施用氮肥过多，土壤排水不良，保水肥力差，冬季重剪使树势变弱，以及遭受冻害等，均可加重病害的发生。另外，多雨发病重，干旱发病少，这也是该病发生的一个特点，通常在春、秋季发生多，尤以5～6月份和9～10月份发病多，夏，秋发病缓慢而少。
防治方法
1、加强栽培管理，增强树势，减少伤口，提高树体的抗病力，避免病菌从伤口侵入。
2、结合修剪，剪除病枝、病叶，集中烧毁，以减少和消灭病源。
3、对已发病的树，彻底刮除病部组织后涂药。药剂可选50％多菌灵100～200倍液，或50％甲基托布津100倍液或用0.1％砷汞水消毒后涂接蜡保护剂。
4、在春梢萌发前、落花2/3时和幼果期各喷一次0.5:1:100的倍量式波尔多液，50％退菌特500～600倍液或50％甲基托布津1000～1500倍液。
九、立枯病
症状及危害：立枯病是柠檬幼苗的重要病害，在田间蔓延迅速，严重危害时常使幼苗死亡。立枯病主要在出上不久的实生苗上发生。幼苗染病后，其靠近地面根颈部的皮层腐烂变褐，根颈缢缩，根皮腐烂，幼苗顶部叶片凋萎，随即自上而下地青枯而死。
病原及发病规律：立枯病为多种真菌所引起，主要有立枯丝核菌、疫霉菌和茎点霉菌三种。病菌以菌丝体或菌核在残体或土壤中越冬，条件适宜时反复传播蔓延。苗圃连作，排水不良，均有利于发病。4～6月份发病较重。尤其是高温高湿或大雨或阴雨绵绵后突然暴晒时，发病多而重。幼苗1～2片真叶时最易感病，60天以上苗龄发病较少。
防治方法
1、苗圃选择在地势较高、排水良好的砂壤土、壤土。
2、苗圃应避免连作。雨后要及时排水松土，改善土壤透气性，防止积水，撒施草木灰。
3、发现病株，及时拔除烧毁，在地面喷1:1:200波尔多液。4、药剂防治。播种前20天，每平方米用5％棉隆30～50g进行土壤消毒。发现病株，用70％敌克松或65％代森锌500倍液，或50％甲基托布津800倍液喷布。5～7天1次，连喷3次。
症状及危害：柠檬疮痂病主要侵染叶、梢、果的幼嫩组织。受害叶片初期出现油渍状小点后呈蜡黄色病斑，随着叶片生长，病斑扩大并逐渐木栓化，病斑周围叶片组织作圆锥状向背面突起，叶正面凹陷，病斑散生或连片，为害严重时常引起叶片畸形扭曲。新梢上的病斑与叶片上的相似，但突起不明显。果实受害后，果皮上常长出许多散生或群生的瘤状突起，果实小畸形、易落。疮痂病危害叶片，枝梢和果实，引起落叶、落果，使产量和品质降低。
病原及发病规律：疮痂病菌属半知菌亚门痂圆孢属的柑桔痂圆孢菌，其分生孢子梗呈圆筒形，该病以菌丝体在病枝叶上越冬，翌年春，当气温达15℃以上和多雨多雾高温时，病斑上产生分生孢子。分生孢子借风、雨传播侵入春梢嫩叶、梢和幼果。本病只侵染感病品种的幼嫩组织，通常在新梢幼叶尚未展开前易感病，谢花后不久的幼果也最易感病。
温度和湿度影响本病的发生流行，本病发生的温度范围为15～24℃，最适温为20～21℃，当温度超过24℃时停止发生，在适温范围内，阴雨连绵或大雾重露天气，有利于病害的发生与流行，此病在瑞丽因气候1～4月春旱严重，5～6月高温，不禾惦痂病发生，因此春梢、早夏梢发生较少，基本不产生危害，而7～9月的阴雨、多雾天气，极易造成在柠檬秋梢、柠檬夏果、秋果上的流行危害。
防治方法
1、药剂防治：药剂保护的重点是嫩叶和幼果。防治春梢的疮痂病，应在春梢新芽萌发至芽长4mm时即开花前喷药，保护幼果，应在谢花三分之二时，或发病初期喷药。药剂种类可选用：0.5～0.8％倍量式波尔多液，50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液，70％甲基托布津可湿性粉剂800～1000倍液，50％大富生可湿性粉剂800～1000倍液，75％百菌清可湿性粉剂800～1000倍液，25％溃疡灵800～1000倍液，喷药次数应根据病情而定，一般隔5～7天喷一次，喷2～3次。
2、冬季清园：结合冬季修剪清园，剪除病枝病叶，同时清除地面枯枝落叶，消灭越冬病源。
3、加强肥水管理，使新梢柚生整齐健壮，增强抗病力。
二、柠檬炭疽病
症状及危害：此病在幼苗、幼果、果实贮藏期发生危害。叶片受害，在叶片上有叶斑型和叶枯型两种，叶斑型病斑多发生在叶边缘或叶尖，多为半圆或近圆形，病部稍下凹，浅灰褐色，与健部界限明显，病斑上常出现排成同心轮纹状的黑色小粒点，(病菌分生孢子盘)。潮湿则变为红色小点，叶枯型多在春季发生，病部多在叶尖，初期病斑为暗绿色，如开水烫伤状，后迅速扩大变为黄褐色，有病组织多呈“V”字形枯死，叶上多生红色小点，常造成叶片腐烂脱落。枝梢一种为灰白色，一种为淡褐色。其上散生黑色小点。幼果受害，初为暗绿色油渍不规则病斑，后扩大至全果。病斑凹陷，长出白色霉层和土红色小点，后使果实腐烂。或僵果挂在树枝上，近成熟果受害后，有干疤、渍痕和软腐三种。
炭疽病危害枝梢、叶片、果实和苗木，常引起落叶、落果、枝梢枯死和苗木死亡。
病因及发病规律：柠檬炭疽病病菌属半知菌亚门有刺炭疽孢属的胶孢炭疽菌，分生孢子长椭圆形。属潜伏侵染性病害。健康组织一般不会发病，但发生严重冻害，或早春低温潮湿，夏秋高温多雨季节，或由于耕作、移栽、长期积水，施肥过多等造成根系损伤，或肥力不足、干旱、虫害严重、农药药害、空气污染等造成树体衰弱，或由于偏施氮肥使植株大量抽发新梢或徒长枝，均能助长病害发生。病菌在病部组织越冬，分生孢子借风、雨和昆虫传播，从伤口、气孔和皮孔侵入，在整个柠檬生长期均可侵染。通常3～4月开始发病，夏梢发病多，最适发病条件是21～28℃的气温条件。
防治方法
1、改善柠檬园管理：做好肥水管理和防虫、防冻等工作，避免造成树体机械损伤，保护健壮的树势。剪除病虫枝、衰弱枝和徒长枝，清除地面落叶，集中烧毁，修剪后在伤口处涂上70％甲基托布津可湿性粉剂100～200倍液。
2、喷药保护：一般树势衰弱的柠檬园在每次抽梢时喷药1次，幼果期喷药2～3次，间隔10～15天，选用的药剂有0.5:1:100波尔多液，0.5波美度的石硫合剂。发病后选用700甲基托布津可湿性粉剂、或50％多菌灵可湿性粉剂500～800倍液，或50％大富生可湿性粉剂600～1000倍液喷雾。
三、煤烟病
症状及危害：此病发病初期在叶、梢、果表面出现暗褐色点状小霉斑，后继续扩大成绒毛状黑色或灰黑色霉层。后期霉层上散生许多黑色小点或刚毛状突起物，呈烟煤状，煤层易剥离，剥离后枝、叶、果表面仍为绿色。主要危害叶片、枝条、果实，严重影响光合作用和果实品质，花少，果小。
病原及发病规律：本病由多种真菌引起，以菌丝体或分生孢子器在病部越冬，来年春季由霉层飞散孢子，落在蚜虫、粉虱或蚧壳的分泌物上，弓!起发病。借风雨传播，在栽培不良，枝叶过密，湿度大，蚜虫或蚧壳虫发生严重的柠檬园发病严重。
防治方法
(1)及时防治蚜虫、蚧壳虫及粉虱类害虫，清除发病条件。
(2)做好冬季清园，合理修剪，改善通风透光条件，做好排水工作，降低果园湿度。
(3)药剂防治：发病初期选用50％甲基托布津可湿性粉剂500～800倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂400倍液，或5％菌毒清500倍液，或0.3～0.5等量式波尔多液或用1:1:300倍尿洗合剂(即尿素1kg，洗衣粉1kg，水300kg)进行防治。
(四)流胶病症状及危害：流胶病是柠檬的主要病害，受害植株的主杆和主枝发生流胶，林势衰弱，树皮坏死，树叶枯黄，产量降低，严重时植株部分枝条及整株死亡。流胶病病斑形状不规则，病部树皮呈褐色水渍状，常有裂口和流胶，干燥时不流胶，病部枝条叶片黄化，无光泽，严重时全株黄化。
病原及发病规律：流胶病由真菌类的疫霉菌引起，病菌在病部组织中进行越冬，该病全年均可发生，但以6～10月份发病重。一般病菌从伤口侵入，高温高湿时发病重，土壤粘重，排水不良，树冠郁闭，施氮肥过重等，均有利于发病，一般幼树发病轻，老树发病重。
防治方法
1、选用抗病的砧木品种枳或红桔，尽量不用香橼做为砧木。
2、建园时选择地势比较高，排水良好的园地。
3、加强栽培管理，增施有机肥，合理进行间作和修剪，增加柠檬园通风透光，冬季进行树杆涂白。
4、加强对天牛和吉丁虫等树干害虫的防治。
5、当病害发生后，用刀将病部的坏死部分刮除，深度可达木质部表层。然后涂50％甲基托布津可湿性粉剂100倍稀释液，或50％多菌 灵可湿性粉剂100倍稀释液，20％甲霜铜(甲霜灵)200～400倍液，冬季涂石硫合剂药渣防治效果较好。
五、溃疡病
症状及危害：叶片发病时，在叶背出现针头大小淡黄色或暗绿色油渍状斑点，后扩大成灰褐色圆形病斑，叶片正反面隆起，随后病部中央破裂木栓化，呈灰白色的火山口状，病斑周围有一暗褐色油腻状和黄色晕环。果实和枝梢上的病斑与叶片相似，但病斑的木栓化程度更为严重，山口状开裂更为显著。
溃疡病危害嫩叶、嫩梢和幼果，常引起落叶落果，枝梢枯死，产量降低，果实品质下降。
病原及发病规律：该病为国内外植物检疫对象，柠檬发病严重，病原为细菌，由野油菜黄单脆杆菌所致，细菌为短杆状，两端圆，病菌在病部组织内越冬。翌年温度适宜，湿度高时，病菌从病斑中溢处，借风、雨、昆虫和枝叶交叉接触传播。远距离的传播则主要通过带菌苗木、接穗和果实。病菌从伤口，气孔和皮孔侵入，此病发生的温度范围为20～32℃，最适为25～30℃，高温高湿天气是流行的必要条件。暴风雨给寄主造成大量伤口，有利于病菌的传播和侵入。
防治方法
1、严格实行植物检疫：柠檬苗木、接穗、砧木、种子和果实的调动要按规定严格实施检疫，防止溃疡病的传播蔓延。保护区发现病株、病苗立即烧毁。
2、培育无病苗木，建立无病苗圃，选择隔离条件好的地域建立苗圃。
3、减少果实和叶片损伤，柠檬园的四周可采取营造防风林，以减少柠檬园风速，及时防治潜叶蛾等害虫，减少虫伤，及时剪除病枝病叶，清除枯枝落叶落果，减少病原。
4、喷药保护嫩梢和幼果。苗木和结果的幼龄树以保梢为主，在春、夏、秋梢萌发后20～30天各喷1～2次药剂进行保护。结果树以保果为主，在谢花后10天、30天、50天各喷药1次。选用的药剂有消菌灵1000～1500倍液，或77％可杀得800～1000倍液，或用0.3～0.5％等量式波尔多液，12％的绿乳铜800～1000倍液，40％氢氧化铜600倍液，25％叶枯灵500～1000倍液，1000×10～6农用链霉素等防治。
六、裂皮病
症状及危害：发病植株的症状一般是砧木部树皮纵向开裂，部分树皮剥落，树冠矮化，新梢小而弱，叶片变小，叶脉及其附近绿色而脉间叶肉黄色，病树开花多，落花落果严重，产量下降，小枝枯死，甚至整株未老先衰。一般带病苗木在苗期无症状，定植4年以后才表现，主要危害柠檬主杆下部或嫁接口部位。
病原及发病规律：病原是一种类病毒，该类病毒没有蛋白质外壳的游离低分子核酸，对各种理化的作用均表现有高度的稳定性，病原通过汁液传播，在柠檬园主要通过修剪和嫁接传播，亦可通过农事操作工具(如修枝剪。嫁接刀，锄头等)或手接触病原，再接触健株而传播。种子不带病，目前尚未发现昆虫对该病传播。
防治方法
1、选择无病母树釆穗繁殖或利用脱毒苗，选用耐病砧木进行嫁接，如红桔等。
2、对修剪、嫁接用的剪、刀等工具，要用10～20％漂白粉溶液浸泡或擦洗消毒，然后用清水冲洗干净，以防病菌传播。
3、苗木除萌或果园抹牙放梢时，应拉扯去芽的方法代替手指抹芽，以免手上沾污的病汁液传播。
4、发现个别或小量病株时，应及时挖除并烧毁，以控制病害蔓延。
七、脚腐病
症状及危害：脚腐病，又名裙腐病，是一种根颈病害。是柠檬的主要病害之一，常在根颈和主根皮层发生危害。病部树皮腐烂呈褐色，有水渍状，有酒糟味，常流出胶质。在高温多雨，土壤排水不良的条件下，病斑迅速扩大。在干燥条件下，病部开裂变硬，病、健部分界明显，初期危害树表皮，后扩展至形成层以至木质部。病斑向纵横方向扩展，向上蔓延至主干距地面约20cm处，向下蔓延至根群，横向可环绕主干一周，使树皮变黄脱落，最后导致植株死亡。主要危害根颈和根群。
病原及发病规律：病原为疫霉属病菌，包括寄生疫霉、柑桔褐疫霉、棕榈疫霉、恶疫霉和甜瓜疫霉等五种。病原以菌丝体在病部组织中越冬，靠雨水传播。此病于4月中旬发病，以7～8月份为盛。高温高湿、土壤排水不良、果园间作高秆作物、栽植密度过大，树冠郁闭，栽植过深(嫁接口埋入土中)、树皮受损伤等，均会促发此病。香橼砧嫁接的柠檬最易感病。
防治方法
1、选用枳砧、红桔砧进行嫁接育苗，提高嫁接部位。
2、种植时栽植不宜过深，嫁接口应露于土外。
3、增施有机肥改良土壤，搞好开沟排水，避免种植高杆作物。
4、病树在刮去病部后，再隔4～5cm处纵割一条深达木质部的割口，涂药防治，用药可选取20％甲霜灵100～200倍液，50％甲基托布津500倍液或5度石硫合剂。
八、树脂病
症状及危害：由于病害所发生时期和危害部位的不同，树脂病有蒂腐病、褐色蒂腐病和黑点病等类型。此病导致树干枝条干枯和流胶，尤其是在冻后受害严重，一般造成减产，严重时会造成树死园毁，树干受害后，病部皮层呈灰褐色或深褐色，水渍状，随即流胶。胶液初为淡褐色，后为褐色，皮层坏死干枯而微翘。死皮有时剥落，使木质部裸露；有时病部干枯，无显著流胶，皮层为红褐色，干枯略下陷，微有裂缝，但不立即剥落。在病健部交界处有一条黄褐或黑褐色菌隆起界线。病部皮层和外露的木质部上有黑色小粒点，木质部变成浅灰褐色。幼果、新梢和叶片受害时，表面生出很多隆起的黑褐色或黄褐色硬胶质小点，使表面变得粗糙，好像附有沙粒一样，故又称为沙皮病。成熟果实或贮藏果实感病后，环绕蒂部出现水渍状淡褐色病斑，渐变为深褐色，并逐渐向基部扩展，边缘呈波纹状，最后全果腐烂。树脂病主要危害主杆、枝、叶以及果实。
病原及发病规律：柠檬树脂病病菌属真菌子囊菌亚门病害。病菌以菌丝体或分生孢子器在病部组织中越冬。分生孢子借风、雨、昆虫等传播。从树体伤口侵入，故伤口是病害流行的先决条件。栽培管理差。施用氮肥过多，土壤排水不良，保水肥力差，冬季重剪使树势变弱，以及遭受冻害等，均可加重病害的发生。另外，多雨发病重，干旱发病少，这也是该病发生的一个特点，通常在春、秋季发生多，尤以5～6月份和9～10月份发病多，夏，秋发病缓慢而少。
防治方法
1、加强栽培管理，增强树势，减少伤口，提高树体的抗病力，避免病菌从伤口侵入。
2、结合修剪，剪除病枝、病叶，集中烧毁，以减少和消灭病源。
3、对已发病的树，彻底刮除病部组织后涂药。药剂可选50％多菌灵100～200倍液，或50％甲基托布津100倍液或用0.1％砷汞水消毒后涂接蜡保护剂。
4、在春梢萌发前、落花2/3时和幼果期各喷一次0.5:1:100的倍量式波尔多液，50％退菌特500～600倍液或50％甲基托布津1000～1500倍液。
九、立枯病
症状及危害：立枯病是柠檬幼苗的重要病害，在田间蔓延迅速，严重危害时常使幼苗死亡。立枯病主要在出上不久的实生苗上发生。幼苗染病后，其靠近地面根颈部的皮层腐烂变褐，根颈缢缩，根皮腐烂，幼苗顶部叶片凋萎，随即自上而下地青枯而死。
病原及发病规律：立枯病为多种真菌所引起，主要有立枯丝核菌、疫霉菌和茎点霉菌三种。病菌以菌丝体或菌核在残体或土壤中越冬，条件适宜时反复传播蔓延。苗圃连作，排水不良，均有利于发病。4～6月份发病较重。尤其是高温高湿或大雨或阴雨绵绵后突然暴晒时，发病多而重。幼苗1～2片真叶时最易感病，60天以上苗龄发病较少。
防治方法
1、苗圃选择在地势较高、排水良好的砂壤土、壤土。
2、苗圃应避免连作。雨后要及时排水松土，改善土壤透气性，防止积水，撒施草木灰。
3、发现病株，及时拔除烧毁，在地面喷1:1:200波尔多液。4、药剂防治。播种前20天，每平方米用5％棉隆30～50g进行土壤消毒。发现病株，用70％敌克松或65％代森锌500倍液，或50％甲基托布津800倍液喷布。5～7天1次，连喷3次。