【摘 要】
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目的 通过构建微小RNA(miRNA)-mRNA-信号通路调控网络,探讨肝癌的潜在生物学标志物.方法 通过GEO数据库获得mRNA和miRNA的表达谱,采用limma包筛选差异表达miRNA(DEmiRNAs)和差异表达mRNA(DEGs).通过miRDB、miRTarBase和TargetScan数据库进行DEmiRNAs靶基因的筛选,再将DEmiRNAs靶基因与DEGs取交集获得肝癌潜在靶基因.对潜在靶基因进行功能和通路富集分析,使用Cytoscape软件构建miRNA-mRNA通路调控网络.结果 共
【机 构】
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广西中医药大学第一附属医院肝病科,南宁市 530023;广西骨伤医院脾胃呼吸科,南宁市 530023;广西中医药大学研究生学院,南宁市 530023;广西中医药大学第一附属医院肝病科,南宁市 5300
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目的 通过构建微小RNA(miRNA)-mRNA-信号通路调控网络,探讨肝癌的潜在生物学标志物.方法 通过GEO数据库获得mRNA和miRNA的表达谱,采用limma包筛选差异表达miRNA(DEmiRNAs)和差异表达mRNA(DEGs).通过miRDB、miRTarBase和TargetScan数据库进行DEmiRNAs靶基因的筛选,再将DEmiRNAs靶基因与DEGs取交集获得肝癌潜在靶基因.对潜在靶基因进行功能和通路富集分析,使用Cytoscape软件构建miRNA-mRNA通路调控网络.结果 共筛选出256个DEGs、213个DEmiRNAs和4010个DEmiRNAs靶基因,取交集后获得肝癌潜在靶基因34个;最终得到55对miRNA-mRNA基因对,包括23个潜在靶基因和17个miRNA.潜在靶基因涉及22个生物学过程、8种分子功能、8个细胞组分,主要富集在7个类型的信号通路,包括细胞增殖与死亡、免疫系统、信号转导、运输和分解代谢、癌症、消化系统、氨基酸代谢等.通过构建miRNA-mRNA-信号通路调控网络,得到肝癌的危险基因有FOS、GADD45 G、RNF125、ZBTB16、CXCL12、EGR1等,危险miRNA有hsa-miRNA-195-5p、hsa-miRNA-221-3p等.结论 FOS、CXCL12、EGR1等DEmiRNAs,以及hsa-miRNA-195-5p、hsa-miRNA-221等DEGs,或可为肝癌的诊断和治疗提供新的线索.
其他文献
目的 探讨妊娠糖尿病(GDM)孕妇产前抑郁发生情况及其与血清神经营养因子和炎性细胞因子水平的关系.方法 选择120例GDM孕妇(GDM组)和40例健康孕妇(对照组)为研究对象.采用患者健康问卷(PHQ-9)调查孕妇抑郁状况,并根据评分将GDM组分为正常组、轻度组、中度组、中重度组4个亚组.采用酶联免疫吸附法测定孕期30周时所有孕妇的血清星形胶质源性蛋白S100 B、胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、白细胞介素(IL)-1、IL-6、肿瘤坏死因子α(TNF-α)水平.比较
目的 观察个体化睡前饮食指导预防老年2型糖尿病患者夜间低血糖的效果.方法 将300例老年2型糖尿病患者随机分为对照组和干预组,每组150例.对照组给予常规护理,干预组在常规护理的基础上给予个体化睡前饮食指导,观察两组患者干预前后睡前(22:00时)、夜间(次日3:00、6:00时)空腹血糖水平及干预过程中夜间低血糖发生率.结果 干预后,干预组患者睡前、次日3:00时、次日6:00时的空腹血糖水平均高于对照组,夜间低血糖发生率低于对照组(均P<0.05).结论 个体化睡前饮食指导能有效降低老年2型糖尿病患者
目的 探讨黄芩苷对人皮肤恶性黑素瘤A875细胞增殖、凋亡和细胞周期的影响.方法 体外培养A875细胞,将细胞分为0μg/mL(对照组)、80μg/mL、160μg/mL、320μg/mL黄芩苷组,每组分别给予相应浓度黄芩苷作用A875细胞,干预48 h、72 h后采用四甲基偶氮唑盐法检测各组细胞存活率,干预7 d后,采用细胞克隆形成实验检测细胞增殖能力,干预72 h后,采用流式细胞术测算各组细胞凋亡率及细胞周期百分比,并采用蛋白质印迹法检测各组细胞半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(Caspase)-3、Caspas
平滑肌细胞异常增殖、迁移造成的表型转化及死亡在多种器官组织疾病中起重要作用.细胞焦亡是一种调控性促炎引起的细胞死亡,目前研究已发现平滑肌细胞焦亡参与动脉粥样硬化、肺动脉高压和膀胱炎症等疾病的发生发展.因此,改善平滑肌细胞功能,抑制平滑肌细胞焦亡,对临床预防和治疗相关疾病具有重要意义.本文就平滑肌细胞焦亡及其相关疾病中作用的研究进展做一综述.
目的 探讨肺炎支原体肺炎(MPP)患儿血清维生素A、E水平及其与肺外并发症的相关性.方法 选取194例MPP患儿(MPP组),并根据是否存在肺外并发症将其分为并发症组(n=68)和无并发症组(n=126)两个亚组,另选取健康儿童100例为对照组.比较MPP组和正常对照组间、并发症组和无并发症组间血清维生素A、E水平及其异常率.采用二元Logistic回归模型分析MPP患儿血清维生素A、E水平与肺外并发症的相关性,并使用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清维生素A、E水平对MPP患儿发生肺外并发症的诊断效能
非创伤性股骨头坏死是骨科常见疾病,发病率高,危害大,可造成残疾等严重后果.目前有研究认为,脂质代谢异常可能是引起非创伤性股骨头坏死的危险因素.本文就脂质代谢相关生物学指标与非创伤性股骨头坏死的相关性研究进展进行综述,同时指出后续研究的可能切入点,为进一步研究非创伤性股骨头坏死提供思路.
目的 探讨老年人甲状腺激素及甲状腺自身抗体水平与急性缺血性脑卒中发病和病情程度的关系.方法 选择200例老年急性缺血性脑卒中患者作为脑卒中组,另选择200例同期老年健康体检者作为对照组,并根据美国国立卫生院研究卒中量表评分标准,将脑卒中组分为轻型亚组、中型亚组、重型亚组.比较两组的一般资料、血脂水平、血清甲状腺激素[游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)、游离四碘甲状腺原氨酸(FT4)、促甲状腺激素(TSH)]水平、甲状腺自身抗体[甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)、甲状腺球蛋白抗体(TgAb)]水平.采用Log
2019年7月9日,健康中国行动推进委员会印发的《健康中国行动(2019-2030年)》提出了科学运动的概念.当前,亟需解决的问题是如何鼓励居民践行科学运动、如何提高居民身体活动意识、如何进行科学的身体活动.科学健走无疑是科学运动中最容易实现的目标,因其简单易行,成本低,不受时间空间限制,不需任何场地和设施设备,大量研究证实其带来的健康收益是巨大的[1].科学健走不仅使腿脚得到锻炼,还可动用身体70％以上的肌肉协调共同参与,一些动作甚至牵扯到90％以上的肌肉.健步走不仅能锻炼体魄与耐力,陶冶心灵和情操,而
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