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目的：探讨质谱仪在真菌感染中的应用，评价其鉴定真菌的能力。方法选取分离自我院住院患者的真菌菌株327株，用质谱仪进行快速鉴定，并与VITEK-2（酵母样真菌）和显微镜检查（丝状真菌）的鉴定结果进行比对，差异结果用分子生物学方法确认鉴定。结果依照质谱仪评分标准，227株酵母样真菌在种水平（〉2.0）的鉴定率为90.31%，在属水平（〉1.7）为98.68%；丝状真菌在种水平的鉴定率为74.00%，在属水平为94.00%。对临床常见的曲霉菌鉴定正确率可达96.74%。结论质谱仪在鉴定真菌的种属水平上都达到了令