【目的】分析新疆杏种质资源表型性状的多样性和变异特点。【方法】以新疆11个杏种质资源居群为研究对象,利用DPS7.05和MEGA3.1软件通过各指标计算、UPGMA聚类和主成分分析其29个表型性状多样性。【结果】Simpson指数和Shannon-weaver指数,均为民丰居群最大,分别为0.960 5和3.930 1,托克逊居群最小,分别为0.840 1和1.928 7;各居群间不同表型性状变异系数的变异幅度在1.65%~57.34%范围内,大多居群多数性状的变异系数都在10%以上;各居群大多以果形指数、叶片长宽比的遗传稳定性较好,而单果质量、硬度、鲜核质量和鲜仁质量的遗传稳定性相对较差;距离系数为12时,11个居群可分为3大类,且洛浦居群和和田居群的遗传距离最小为11.631 7,阿合奇居群和英吉沙居群的遗传距离最大为36.232 8;29个性状的主成分分析中前10个主成分的累计贡献率为71.59%。【结论】民丰居群的表型多样性最丰富,托克逊居群的表型多样性最小;洛浦居群和和田居群的亲缘关系最近,阿合奇居群和英吉沙居群亲缘关系最远;各居群变异较大,单果质量、鲜核质量、鲜仁质量、果实形状、叶片长度、叶片宽度、叶柄长度、叶片长宽比、果顶、果形指数、风味、硬度和可溶性固形物含量等是造成表型差异的主要因素。