【摘 要】
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翻译延伸因子EF-1α（elongation factor 1 alpha）是细胞中最丰富的蛋白质之一，其在确保mRNA正确解码以产生细胞蛋白质方面发挥重要作用。该研究采用RT-PCR扩增方法克隆香菜CsEF-1α基因序列，利用生物信息学对CsEF-1α基因结构、序列特征及系统进化等进行分析，并采用qPCR探究CsEF-1α基因在香菜不同生长时期和非生物胁迫下的表达模式，为进一步揭示EF-1α基因
【基金项目】
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新疆生产建设兵团重大科技计划项目（2016AA002-2）； 塔里木大学校长基金项目（TDZKSS202245）；
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翻译延伸因子EF-1α（elongation factor 1 alpha）是细胞中最丰富的蛋白质之一，其在确保mRNA正确解码以产生细胞蛋白质方面发挥重要作用。该研究采用RT-PCR扩增方法克隆香菜CsEF-1α基因序列，利用生物信息学对CsEF-1α基因结构、序列特征及系统进化等进行分析，并采用qPCR探究CsEF-1α基因在香菜不同生长时期和非生物胁迫下的表达模式，为进一步揭示EF-1α基因调控机制的研究奠定基础。结果显示：（1）成功克隆获得香菜CsEF-1α基因序列；CsEF-1α基因包含1个1 344 bp的开放阅读框，编码447个氨基酸，分子式为C2202H3544N594O644S20,蛋白质分子量为49.29 kD,等电点为9.12;氨基酸序列组成中赖氨酸数量最多（49个，占11.0%）,色氨酸数量最少（3个，占0.7%）;属碱性蛋白。（2）CsEF-1α蛋白主要由无规则卷曲（36.91%）和α-螺旋（30.43%）构成，定位于细胞质；系统进化树分析显示，CsEF-1α与胡萝卜、野生番茄、青蒿素和非洲菊的亲缘关系较接近；启动子分析包括4种植物生长发育元件、3种激素响应元件和3种胁迫响应元件。（3）qRT-PCR结果显示，CsEF-1α基因的表达量随着香菜生长发育时间的延长而升高，并且与转录丰度的变化一致；CsEF-1α基因对4种不同非生物胁迫的响应表达模式有所差异；随着胁迫时间的延长，在盐胁迫下CsEF-1α基因表现出先升高后降低趋势，而在低温、高温和干旱胁迫下表现出先降低再升高的趋势。研究表明，CsEF-1α基因参与了香菜对非生物胁迫的应答，在香菜生长发育和非生物胁迫中具有重要调控作用。
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