【摘 要】
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目的本研究基于肝癌相关非编码RNA高通量测序数据,构建互作网络及功能富集分析,筛选可能通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制参与肝癌发生发展的环状RNA(circRNA)。方法 利用GEO数
【机 构】
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陕西中医药大学,陕西中医药大学附属医院肝胆外科,陕西中医药大学附属医院肝病一科
【基金项目】
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国家自然科学基金(81603612);陕西省科技厅科研基金(2016SF-234,2018KJXX-093);宁夏回族自治区自然科学基金(NZ17278)
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目的本研究基于肝癌相关非编码RNA高通量测序数据,构建互作网络及功能富集分析,筛选可能通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制参与肝癌发生发展的环状RNA(circRNA)。方法 利用GEO数据库中的肝癌非编码RNA高通量测序数据,依据ceRNA理论构建circRNA-miRNA-mRNA网络。随后,进行了基因本体论分析(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,用于具有ceRNA潜在功能的circRNA的探索及功能注释。结果 从GEO数据库中最终筛选了9个共表达circRNAs、20个共表达miR
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