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基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进化距离,进而对两组蛋白质序列进行系统发生分析,结果证实了该方法的有效性。
蛋白质序列基于k-字的数值刻画及应用
【摘 要】
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基于氨基酸的一种5-字母分类模型,将蛋白质序列转化为5-字母序列,再借助序列中1-字和2-字的频数,将序列转化为一个30维的向量。通过计算两两向量间的欧氏距离得到物种间的进
【机 构】
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渤海大学数理学院
【出 处】
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浙江农业学报
【发表日期】
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2014年6期
【基金项目】
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辽宁省“百千万人才工程”项目（2012921060）, 辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划（LJQ2011122）
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