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针对时变频率选择性信道下的单载波编码传输系统，提出了基于变分推理的低复杂度Turbo频域均衡与信道估计联合迭代算法。所设计的软输入软输出检测器和子块问干扰抵消器能统一处理信道估计误差的影响。通过分析接收信号因子图，提出了算法实现的双迭代结构，内迭代完成联合频域均衡与软信道估计，外迭代进行软干扰抵消和解码。仿真结果表明，所提出算法的误码率性能和对叠加训练信号强度的稳健性均优于具有相似复杂度的期望最大化方案。