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目的:建立百合药材指纹图谱,结合多元统计分析方法,寻找并鉴别百合药材中的质量差异标志物。方法:采用HPLC法建立百合的指纹图谱,结合聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘判别分析进一步确定百合药材的质量标志物。结果:15批百合样品指纹图谱具有14个共有峰,各批样品与对照图谱的相似度均>0.910,指纹图谱方法重复性良好;聚类分析和主成分分析结果表明15批百合样品可分成4类,正交偏最小二乘判别分析表明色谱峰4、6、7、9、11～14号可作为区分百合质量差异的标志物。结论:该研究进一步弥补了百合质量评价标准,可为百合的药效物质基础研究提供参考。