目的分析2012年重庆一区两县基本公共卫生服务项目实施中存在的问题,为基本公共卫生服务项目的开展提供有益的借鉴。方法 2013年3—4月,采用分层随机抽样的方法,选取重庆市九龙坡区、璧山县和奉节县为调查区县,由当地卫生行政部门及项目监管和实施部门提供相关资料,并对卫生局主管领导进行深度访谈。结果九龙坡区、璧山县和奉节县平均每千人所拥有的基层卫生人员或基层执业(助理)医师分别为0.64、2.39、1.64人,人均基本公共卫生服务费标准分别为29、30、25元。3个区县2012年的健康档案建档率均≥80.00%,计划免疫建证率均达到了100.00%,高血压患者的管理率为30.00%~40.00%,2型糖尿病患者的健康管理率为30.00%~40.00%,重性精神疾病患者的规范管理率均≥80.00%。新生儿访视率、儿童健康管理率及儿童系统管理率均≥80.00%。孕产妇剖宫产率分别为53.46%、70.00%和44.57%,均超出了世界卫生组织15%~20%的标准。老年人健康体检表完整率均≥90.00%。传染病及突发公共卫生事件报告和处理工作的所有考核基本达标。结论重庆市基本公共卫生服务项目总体开展情况良好,但高血压、2型糖尿病和重性精神疾病患者的健康管理工作有待提高,孕产妇剖宫产率均超出世界卫生组织标准;主要原因是基层医疗卫生机构缺乏专业技术人员,资金不足,居民参与度待提升。