基于生物信息学途径食管鳞癌lncRNA预后风险模型的构建

来源 :中山大学学报:医学科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:g1f2l3x4j5
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【目的】基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库食管鳞癌lncRNA差异表达,构建食管鳞癌预后风险模型。【方法】从TCGA肿瘤数据库下载食管鳞癌基因表达数据及临床信息,使用R 4.0.3软件提取差异表达lncRNA,进一步使用COX回归分析筛选模型lncRNA,并构建预后风险模型Riskscore;按照风险评分中位值将食管鳞癌患者分为低风险组和高风险组,进一步比较高低风险组生存预后;分析比较风险模型及其他临床特征对食管鳞癌生存预后的预测性能;分析风险评分与其他临床特征相关性;采用主成分分析(PCA)及基因富集
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【目的】探究丙烯醛是否能够诱发体内外发生铁死亡现象。【方法】体外:给予小鼠海马神经元细胞系HT22细胞丙烯醛进行造模,采用铁死亡抑制剂铁抑素-1(Fer-1)与去铁胺(DFO)进行保护。MTT法检测细胞存活率;自由基探针二氢乙啶(DHE)与亚铁探针FerroOrange检测细胞内自由基与亚铁离子含量;透射电镜观察正常与模型组的线粒体超微形态与结构;Westernblot法检测铁死亡相关蛋白表达的情况。体内:雄性C57BL/6小鼠,7~8周龄每日给予3 mg/kg的丙烯醛分别进行造模1、2、4周,并对海马区
目的建立一个基于卷积神经网络(CNN)的人工智能(AI)系统,能够自动识别睑板腺的腺体,并评估睑板腺的各项形态参数。方法由两位高级职称医师手动标注训练图像中的睑板腺,并使用U-Net网络构建了基于CNN的AI系统,该系统能够自动处理睑板腺图片,识别出睑板腺的单根腺体。选取2020年12月至2021年3月在温州医科大学附属眼视光医院杭州院区就诊的60例受试者,其中阻塞性睑板腺功能障碍(MGD)患者3
【目的】在阿尔茨海默病(AD)APP/PS1/Tau(3×Tg)转基因小鼠模型中,探究四甲基吡嗪衍生物T-006改善3×Tg转基因小鼠学习与记忆功能的效果和机理。【方法】本研究以8月龄的3×Tg小鼠及同窝野生型小鼠为研究对象,实验小鼠分为WT组、WT+T-006(10 mg/kg)组、3×Tg组、T-006低中高剂量组(1、3和10 mg/kg)、多奈哌齐组(1.3 mg/kg)、美金刚组(5 mg/kg);T-006、多奈哌齐1 d给药1次,美金刚1 d给药2次,连续给药4个月;利用新物体识别、电跳台和
【目的】探讨宿主免疫系统在广州管圆线虫感染所致脑炎发病机制中的作用。【方法】大鼠是广州管圆线虫适宜宿主,小鼠是其非适宜宿主。采用广州管圆线虫感染SD大鼠和BALB/c小鼠模型,观察感染21 d后宿主中枢免疫器官胸腺以及外周免疫器官脾脏的差异变化,并通过流式细胞技术检测感染后大、小鼠胸腺和脾脏中细胞亚型的变化。【结果】广州管圆线虫感染21 d后,大鼠胸腺和脾脏外观没有明显改变;正常组和感染组胸腺细胞总数以及胸腺细胞中各细胞亚型(CD4+T细胞、CD8+T细胞、CD
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【目的】比较不同病理分级HCC肿瘤内脂肪含量差异,并分析肿瘤脂肪含量在预测HCC病理分级中的潜在价值。【方法】回顾性分析行MRIDixon检查且经病理证实的96例HCC,按照Edmondson-Steiner病理分级法将其分为非低分化组和低分化组。2名观察者分别测量两组病灶内的脂肪体积分数(FVF),比较两组间FVF的差异,并分析肿瘤FVF在预测HCC病理分级中的潜在意义。【结果】2名检测者测得病灶FVF结果一致性良好(ICC>0.75)。非低分化组HCCFVF值[15.75(12.37~21.32
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【目的】探讨不同孕期的血脂值及其与妊娠期并发症的关系。【方法】纳入2018年1月至2018年8月期间在中山大学附属第一医院分娩及产检的孕妇1017例,分析不同孕期血脂水平。使用单因素Logistic回归模型检测妊娠期并发症的影响因素,多因素Logistic回归模型检测不同孕期的血脂水平与妊娠期并发症的发病风险。根据95%参考值范围计算出本院孕期血脂临界值。【结果】孕期血脂水平总体呈升高趋势,升高幅度最显著的是甘油三酯(TG)。年龄、孕前体质指数、血脂水平均与妊娠期并发症相关。在孕中、晚期,随着TG的升高,