棉花基因组中赤霉素氧化酶基因的鉴定与分析

来源 :江苏农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：liongliong603

【摘要】

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根据赤霉素氧化酶氨基酸序列的保守结构域和生物学信息,对棉花2个二倍体野生种(A基因组的亚洲棉和D基因组的雷蒙德氏棉)和2个异源四倍体遗传标准系(陆地棉TM-1和海岛棉H7124)

【作者】

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赵亮狄佳春陈旭升

【机构】

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江苏省农业科学院经济作物研究所/农业农村部长江下游棉花与油菜重点实验室

【出处】

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江苏农业学报

【发表日期】

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2020年3期

【关键词】

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棉花赤霉素赤霉素氧化酶基因家族 cottongibberellic acidgibberellin oxidasegene family

【基金项目】

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国家自然科学基金青年科学基金项目(31401429),江苏省自然科学基金面上基金项目(BK20181245)

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根据赤霉素氧化酶氨基酸序列的保守结构域和生物学信息,对棉花2个二倍体野生种(A基因组的亚洲棉和D基因组的雷蒙德氏棉)和2个异源四倍体遗传标准系(陆地棉TM-1和海岛棉H7124)进行了全基因组的查找。结果表明,在2个二倍体野生种的A和D基因组中分别预测到219和188个该酶类基因家族成员;在异源四倍体陆地棉TM-1和H7124中分别预测到了310和428个该酶类基因家族成员。通过分析陆地棉中预测到的310个该酶类基因家族成员在赤霉素敏感超矮突变体和野生型转录组中表达差异,发现16个基因具有显著性差异。利用

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